104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003769 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  69.28 
 
 		 836 aa  1170    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  91.06 
 
 		 817 aa  1527    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  56.18 
 
 		 817 aa  938    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  100 
 
 		 817 aa  1670    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.99 
 
 		 819 aa  293  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.23 
 
 		 820 aa  286  9e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  27.61 
 
 		 889 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  27.71 
 
 		 889 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  27.47 
 
 		 879 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 		 884 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  28.26 
 
 		 865 aa  269  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  27.95 
 
 		 840 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.72 
 
 		 820 aa  263  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  29.23 
 
 		 825 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  28.01 
 
 		 849 aa  262  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  29.17 
 
 		 887 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  28.24 
 
 		 897 aa  258  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  26.64 
 
 		 836 aa  258  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.75 
 
 		 836 aa  256  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  28.15 
 
 		 887 aa  255  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  28.09 
 
 		 821 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  27.64 
 
 		 878 aa  252  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  29.52 
 
 		 815 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  28.47 
 
 		 889 aa  248  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  28.41 
 
 		 821 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  28.77 
 
 		 850 aa  241  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 800 aa  240  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  27.29 
 
 		 821 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  27.84 
 
 		 845 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.15 
 
 		 849 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  27.47 
 
 		 850 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.43 
 
 		 800 aa  228  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  30.66 
 
 		 802 aa  219  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  27.82 
 
 		 804 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  24.3 
 
 		 803 aa  201  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.5 
 
 		 847 aa  197  7e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  27.03 
 
 		 793 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  26.27 
 
 		 837 aa  191  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.23 
 
 		 855 aa  187  5e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 		 847 aa  187  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  24.19 
 
 		 813 aa  177  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  29.94 
 
 		 795 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.33 
 
 		 866 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.53 
 
 		 870 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  29.77 
 
 		 795 aa  169  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  34.42 
 
 		 826 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  30.93 
 
 		 821 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  31.55 
 
 		 846 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  31.94 
 
 		 845 aa  145  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.58 
 
 		 843 aa  134  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 839 aa  134  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  29.85 
 
 		 872 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  29.61 
 
 		 819 aa  129  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  29.61 
 
 		 819 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  31.33 
 
 		 819 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.36 
 
 		 858 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  30.08 
 
 		 820 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  32.96 
 
 		 795 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 		 842 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  25.56 
 
 		 842 aa  116  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 842 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.71 
 
 		 841 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  22.24 
 
 		 858 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  22.51 
 
 		 846 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  26.1 
 
 		 843 aa  106  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  23.84 
 
 		 929 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  22.63 
 
 		 857 aa  105  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 857 aa  102  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  21.84 
 
 		 884 aa  94.4  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  26.66 
 
 		 753 aa  92  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  22.55 
 
 		 855 aa  91.7  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  22.28 
 
 		 868 aa  77  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  20.98 
 
 		 844 aa  71.6  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  24.13 
 
 		 855 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  21.53 
 
 		 867 aa  68.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  28.69 
 
 		 877 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  23.98 
 
 		 853 aa  62.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 852 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 835 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 835 aa  56.2  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  20.88 
 
 		 861 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.1 
 
 		 851 aa  55.1  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  21.88 
 
 		 866 aa  54.7  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  20.22 
 
 		 842 aa  53.9  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  19.42 
 
 		 854 aa  53.5  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 		 877 aa  52.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2748  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 		 786 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.076782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  21.56 
 
 		 839 aa  48.9  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 856 aa  48.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  25 
 
 		 425 aa  48.1  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.15 
 
 		 413 aa  48.1  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  26.45 
 
 		 870 aa  47.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2842  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 786 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  20.29 
 
 		 841 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  20.85 
 
 		 843 aa  47  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  21.28 
 
 		 422 aa  47.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0071  hypothetical protein  20.05 
 
 		 841 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2873  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 792 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  21.04 
 
 		 859 aa  46.6  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>