105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003763 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00852  hypothetical protein  65.17 
 
 
561 aa  704    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2795  YidE/YbjL duplication  65.17 
 
 
561 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1362  hypothetical protein  64.97 
 
 
561 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0715  hypothetical protein  88.65 
 
 
558 aa  925    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2649  hypothetical protein  67.25 
 
 
562 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02636  hypothetical protein  97.26 
 
 
560 aa  1006    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0950  hypothetical protein  65.17 
 
 
561 aa  704    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0919  hypothetical protein  64.97 
 
 
561 aa  701    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1639  hypothetical protein  66.08 
 
 
562 aa  704    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1559  hypothetical protein  67.25 
 
 
562 aa  716    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2734  hypothetical protein  67.25 
 
 
562 aa  716    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2749  hypothetical protein  65.17 
 
 
561 aa  704    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00537739 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0874  hypothetical protein  65.17 
 
 
561 aa  704    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938397  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2485  hypothetical protein  65.17 
 
 
561 aa  704    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0943  hypothetical protein  65.75 
 
 
561 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1004  hypothetical protein  65.75 
 
 
561 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492051  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1023  hypothetical protein  65.75 
 
 
561 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0907  hypothetical protein  65.75 
 
 
561 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0975  hypothetical protein  65.56 
 
 
561 aa  705    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2029  hypothetical protein  79.06 
 
 
560 aa  839    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0129834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1001  hypothetical protein  65.17 
 
 
561 aa  704    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588292  normal  0.272604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2293  hypothetical protein  64.51 
 
 
562 aa  680    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00858  hypothetical protein  65.17 
 
 
561 aa  704    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2393  hypothetical protein  65.1 
 
 
562 aa  694    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1686  hypothetical protein  65.69 
 
 
562 aa  702    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0560693  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1952  hypothetical protein  64.51 
 
 
562 aa  693    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00456321  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003763  TrkA Potassium channel-family protein  100 
 
 
511 aa  1028    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000044665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1586  YidE/YbjL duplication  29.48 
 
 
563 aa  213  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0336544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1985  YidE/YbjL duplication  29.42 
 
 
561 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0595755 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0870  YidE/YbjL duplication  29.9 
 
 
534 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2143  hypothetical protein  27.75 
 
 
562 aa  203  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2707  YidE/YbjL duplication  28.49 
 
 
564 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03065  hypothetical protein  27.52 
 
 
575 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2952  YidE/YbjL duplication  28.04 
 
 
579 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3045  YidE/YbjL duplication  27.94 
 
 
560 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3839  YidE/YbjL duplication  27.78 
 
 
562 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3938  YidE/YbjL duplication  28.74 
 
 
559 aa  186  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1851  YidE/YbjL duplication  28.4 
 
 
561 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0417927  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4738  YidE/YbjL duplication  27.59 
 
 
581 aa  183  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1198  probable membrane permease  28.09 
 
 
625 aa  172  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1568  YidE/YbjL duplication  27.86 
 
 
559 aa  167  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0856  YidE/YbjL duplication  28.57 
 
 
537 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.682157  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4847  putative transporter  27.81 
 
 
567 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0674099  normal  0.346719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1965  YidE/YbjL duplication  28.21 
 
 
549 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103303  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3841  YidE/YbjL duplication  26.68 
 
 
565 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0788  YidE/YbjL duplication  28.05 
 
 
560 aa  156  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.442707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3892  aspartate/alanine exchanger family protein  28.43 
 
 
560 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3913  YidE/YbjL domain-containing protein  29.36 
 
 
589 aa  153  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0230126  normal  0.101846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2711  YidE/YbjL duplication  27.64 
 
 
549 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129476  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0018  YidE/YbjL duplication  25.65 
 
 
529 aa  152  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0175151  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3482  YidE/YbjL duplication  28.43 
 
 
563 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4138  hypothetical protein  27.67 
 
 
553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03568  hypothetical protein  27.72 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2708  YidE/YbjL duplication  27.88 
 
 
561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3896  hypothetical protein  27.72 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4048  hypothetical protein  27.72 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.926821  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4196  hypothetical protein  27.67 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03512  hypothetical protein  27.72 
 
 
553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0015  hypothetical protein  26.3 
 
 
553 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0096  YidE/YbjL duplication  27.67 
 
 
561 aa  148  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0519277  normal  0.835648 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0019  YidE/YbjL duplication  27.52 
 
 
553 aa  147  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4191  hypothetical protein  27.52 
 
 
553 aa  147  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0018  hypothetical protein  27.52 
 
 
553 aa  147  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4236  hypothetical protein  27.52 
 
 
553 aa  147  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5115  hypothetical protein  27.52 
 
 
561 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.44003 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0789  YidE/YbjL duplication  28.96 
 
 
560 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4089  hypothetical protein  27.33 
 
 
553 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4017  hypothetical protein  27.33 
 
 
553 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.837569  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4034  hypothetical protein  27.33 
 
 
553 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3893  aspartate/alanine exchanger family protein  28.3 
 
 
560 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0607  YidE/YbjL duplication  26.4 
 
 
541 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617712  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0562  hypothetical protein  25.67 
 
 
558 aa  138  3.0000000000000003e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3636  YidE/YbjL duplication  27.77 
 
 
546 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000380153  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0036  hypothetical protein  24.65 
 
 
552 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3793  hypothetical protein  24.95 
 
 
552 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.212534  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4141  hypothetical protein  24.95 
 
 
552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0013  hypothetical protein  24.95 
 
 
552 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0050  hypothetical protein  27.96 
 
 
552 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.259185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1470  hypothetical protein  25.38 
 
 
552 aa  126  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0186692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0042  hypothetical protein  24.85 
 
 
552 aa  126  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2550  TrkA-C:YidE/YbjL duplication  28.24 
 
 
546 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172993  hitchhiker  0.00000000000069423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2351  YidE/YbjL duplication  25.29 
 
 
531 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000718232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1016  Trk family potassium uptake protein  26.53 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2318  YidE/YbjL like transporter  25.92 
 
 
544 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0281  YidE/YbjL duplication  24.14 
 
 
549 aa  108  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00426862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1848  YidE/YbjL duplication  25.45 
 
 
545 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1411  hypothetical protein  25.88 
 
 
561 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.540338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1552  YidE/YbjL duplication  25.51 
 
 
544 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01390  predicted permease  28.5 
 
 
522 aa  96.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0891  YidE/YbjL duplication  23.9 
 
 
533 aa  94.4  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1553  YidE/YbjL duplication  24.55 
 
 
529 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0482  YidE/YbjL duplication  24.6 
 
 
527 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17890  YidE/YbjL duplication  25.5 
 
 
521 aa  84  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.286246  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0037  YidE/YbjL duplication  23.98 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1476  YidE/YbjL duplication  26.21 
 
 
530 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.417423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1280  YidE/YbjL duplication  23.31 
 
 
531 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2470  YidE/YbjL duplication  24.64 
 
 
522 aa  70.1  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00004763  hitchhiker  0.00816269 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1872  YidE/YbjL duplication  28.19 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.590768  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4141  YidE/YbjL duplication  24.51 
 
 
530 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0300  YidE/YbjL duplication  29.55 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>