53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003718 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003718  putative SpoOM-related protein  100 
 
 
247 aa  508  1e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02077  hypothetical protein  89.47 
 
 
247 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1761  putative sporulation-control protein  63.41 
 
 
248 aa  321  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0034341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2848  SpoOM-related protein  44.35 
 
 
246 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1458  SpoOM family protein  42.68 
 
 
246 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2729  SpoOM family protein  43.1 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.863876  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2662  SpoOM family protein  43.1 
 
 
246 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2836  SpoOM family protein  43.1 
 
 
246 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2305  SpoOM family protein  37.65 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.983136  normal  0.530714 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3245  SpoOM family protein  37.02 
 
 
250 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2416  putative sporulation-control protein Spo0M  37.33 
 
 
251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2091  sporulation-control protein  36.89 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00354659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2087  sporulation-control protein  36.89 
 
 
251 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2153  sporulation-control protein Spo0M  36.73 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0500171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2308  sporulation-control protein Spo0M  36.73 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2333  putative sporulation-control protein Spo0M  41.94 
 
 
251 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3034  putative sporulation-control protein Spo0M  36.44 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2907  SpoOM  32.93 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2125  SpoOM family protein  36 
 
 
251 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.359088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1236  SpoOM family protein  35.94 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2289  putative sporulation-control protein Spo0M  40.65 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2353  SpoOM family protein  32.73 
 
 
259 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1337  SpoOM family protein  34.67 
 
 
241 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1597  SpoOM family protein  33.19 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2980  putative SpoOM-related protein  31.75 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.771223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3153  SpoOM family protein  35.32 
 
 
254 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0145478  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4403  SpoOM family protein  32.26 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.294565  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3762  SpoOM family protein  33.33 
 
 
376 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.548375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0270  SpoOM family protein  30 
 
 
262 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2575  SpoOM family protein  30.96 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0409  SpoOM family protein  34.47 
 
 
335 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311537  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1549  SpoOM family protein  32.29 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0376095  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4556  SpoOM family protein  32.74 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5804  Sporulation control protein-like protein  33.64 
 
 
323 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0466499  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4399  SpoOM family protein  30.93 
 
 
270 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0063  SpoOM family protein  34.15 
 
 
259 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.656988  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1589  SpoOM family protein  31.39 
 
 
317 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.724743  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20360  sporulation control protein  33.05 
 
 
256 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585813  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2480  SpoOM-related protein  28.15 
 
 
280 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1250  hypothetical protein  28.02 
 
 
324 aa  99.4  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0951  SpoOM family protein  30.38 
 
 
397 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.779484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00398  sporulation control protein  28.47 
 
 
268 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0048  putative sporulation-control protein  33.17 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0812821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002050  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 
268 aa  95.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4400  SpoOM family protein  28.63 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0185  SpoOM family protein  30.38 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2148  SpoOM family protein  32.39 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1070  SpoOM family protein  27.95 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0420  SpoOM family protein  30.97 
 
 
321 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000132469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1266  SpoOM family protein  31.47 
 
 
132 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000350591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1370  SpoOM family protein  25.22 
 
 
305 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427443  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1411  SpoOM family protein  22.52 
 
 
312 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1506  SpoOM family protein  25 
 
 
318 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118009  hitchhiker  0.00241219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>