More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003565 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  90.37 
 
 
592 aa  1022    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  100 
 
 
591 aa  1200    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3252  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  49.48 
 
 
601 aa  585  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.63 
 
 
593 aa  565  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.54 
 
 
592 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1059  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.96 
 
 
591 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0520  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.53 
 
 
593 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0501  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.53 
 
 
593 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.300682  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0564  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.53 
 
 
593 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.550146  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.53 
 
 
593 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0510  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.53 
 
 
593 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.991791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2866  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.43 
 
 
594 aa  545  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.749426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.45 
 
 
593 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  48.63 
 
 
593 aa  545  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.45 
 
 
593 aa  543  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.63 
 
 
593 aa  545  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.63 
 
 
593 aa  545  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.63 
 
 
593 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  48.45 
 
 
593 aa  543  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.95 
 
 
597 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.45 
 
 
593 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3221  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.36 
 
 
607 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3079  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.36 
 
 
607 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3040  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  48.36 
 
 
607 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.636426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  41.59 
 
 
587 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  41.42 
 
 
587 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 
587 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  40.91 
 
 
587 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.91 
 
 
587 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
587 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.91 
 
 
587 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.91 
 
 
587 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  40.8 
 
 
587 aa  444  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  40.94 
 
 
587 aa  442  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.73 
 
 
587 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  38.99 
 
 
594 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
592 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.48 
 
 
579 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.13 
 
 
581 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  40.72 
 
 
606 aa  412  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39 
 
 
666 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39 
 
 
666 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  39.19 
 
 
666 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.19 
 
 
666 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  40.31 
 
 
666 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39 
 
 
666 aa  371  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39 
 
 
666 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  39.19 
 
 
666 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  40.32 
 
 
677 aa  360  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  38.61 
 
 
666 aa  359  7e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  37.29 
 
 
600 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.1 
 
 
599 aa  356  5.999999999999999e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.7 
 
 
597 aa  350  5e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.03 
 
 
594 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  36.6 
 
 
588 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.22 
 
 
604 aa  335  1e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  32.48 
 
 
602 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  33.85 
 
 
602 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  32.86 
 
 
592 aa  330  6e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  34.49 
 
 
592 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  38.19 
 
 
650 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  33.78 
 
 
685 aa  324  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0902  ABC transporter related  34.48 
 
 
579 aa  323  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00896089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0880  ABC transporter related  34.48 
 
 
579 aa  323  5e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000184481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  34.53 
 
 
590 aa  322  9.000000000000001e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33 
 
 
622 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.39 
 
 
614 aa  321  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  32.88 
 
 
603 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  33.1 
 
 
611 aa  319  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0963  ABC transporter related  31.27 
 
 
599 aa  318  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.798601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
600 aa  317  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  34.36 
 
 
594 aa  316  6e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.84 
 
 
617 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  33.39 
 
 
589 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  32.59 
 
 
602 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  33.63 
 
 
625 aa  312  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  34.49 
 
 
588 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  31.94 
 
 
591 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  31.7 
 
 
586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  34.62 
 
 
632 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1382  ABC transporter related  30.96 
 
 
578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.372914  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  32.94 
 
 
607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  32.35 
 
 
582 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  33.74 
 
 
611 aa  303  5.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  31.57 
 
 
616 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  34.13 
 
 
603 aa  301  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.58 
 
 
592 aa  300  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  31.62 
 
 
645 aa  300  7e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3070  ABC transporter related  33.16 
 
 
604 aa  299  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.195979  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  34.22 
 
 
632 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  32.42 
 
 
613 aa  296  9e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  34.57 
 
 
619 aa  296  9e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  34.1 
 
 
663 aa  296  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0218  ABC transporter related  30.93 
 
 
603 aa  296  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.045822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  30.16 
 
 
584 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  32.16 
 
 
588 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  33.74 
 
 
600 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  32.41 
 
 
619 aa  293  5e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  31.15 
 
 
585 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  32.23 
 
 
608 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>