More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003549 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003549  FMN-dependent NADH-azoreductase  100 
 
 
194 aa  393  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02502  azoreductase  91.75 
 
 
213 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3478  azoreductase  62.56 
 
 
197 aa  261  3e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3398  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  61.73 
 
 
196 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.27302  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0307  azoreductase  60.51 
 
 
197 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000628195  hitchhiker  0.0000000950602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3529  azoreductase  60.94 
 
 
197 aa  248  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000068989  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0321  azoreductase  61.73 
 
 
198 aa  244  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000292706  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3703  azoreductase  61.73 
 
 
198 aa  244  6e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000384963  normal  0.290118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0316  azoreductase  61.22 
 
 
198 aa  241  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001628  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0320  azoreductase  60.62 
 
 
198 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000159762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4396  azoreductase  58.88 
 
 
198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0325  azoreductase  60.1 
 
 
198 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000173737  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0324  azoreductase  60.1 
 
 
198 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00233774  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0319  azoreductase  60.1 
 
 
198 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000641081  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2233  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  60.1 
 
 
201 aa  236  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1495  azoreductase  60.1 
 
 
201 aa  236  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0423  azoreductase  59.59 
 
 
198 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2246  azoreductase  60.1 
 
 
201 aa  236  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2015  azoreductase  60.1 
 
 
201 aa  236  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0590864 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1632  azoreductase  60.1 
 
 
201 aa  236  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.578  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1593  azoreductase  60.1 
 
 
201 aa  236  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1760  azoreductase  59.6 
 
 
201 aa  235  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000599695 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1745  azoreductase  58.29 
 
 
201 aa  235  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.398442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0334  azoreductase  59.69 
 
 
197 aa  234  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  59.6 
 
 
201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  59.6 
 
 
201 aa  232  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2596  azoreductase  57.07 
 
 
201 aa  228  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2589  azoreductase  56.06 
 
 
201 aa  227  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1782  azoreductase  54.77 
 
 
201 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1814  azoreductase  56.57 
 
 
201 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.479153  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1924  azoreductase  56.57 
 
 
201 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2218  azoreductase  56.57 
 
 
201 aa  225  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0480053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  55.9 
 
 
201 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1242  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  56.99 
 
 
206 aa  223  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0937956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2289  azoreductase  55.56 
 
 
201 aa  222  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0626375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  57.69 
 
 
201 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  57.69 
 
 
201 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  57.69 
 
 
201 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  57.69 
 
 
201 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  57.14 
 
 
201 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1209  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.59 
 
 
232 aa  207  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.111385  normal  0.974123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.74 
 
 
199 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.77 
 
 
199 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.28 
 
 
199 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  48.24 
 
 
199 aa  192  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  48.28 
 
 
204 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.26 
 
 
199 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2923  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50.25 
 
 
199 aa  190  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.660673  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.73 
 
 
199 aa  188  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.9 
 
 
209 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.15 
 
 
213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2866  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  51.1 
 
 
198 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88818  normal  0.601699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  53.21 
 
 
199 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3615  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  51.1 
 
 
198 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  44.1 
 
 
213 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.19 
 
 
199 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0457  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.55 
 
 
198 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0916027 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1916  FMN-dependent NADH-azoreductase  46.46 
 
 
237 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3589  FMN-dependent NADH-azoreductase  46.46 
 
 
237 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3562  FMN-dependent NADH-azoreductase  46.46 
 
 
237 aa  175  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0650  FMN-dependent NADH-azoreductase  46.46 
 
 
237 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0946  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.46 
 
 
237 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4167  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.96 
 
 
208 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0527  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.46 
 
 
198 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3581  acyl carrier protein phosphodiesterase  46.46 
 
 
198 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876616  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0433  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50 
 
 
198 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.209861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2915  acyl carrier protein phosphodiesterase  45.96 
 
 
198 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0528  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  50 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0500  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.918757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2577  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  50 
 
 
198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0455  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  47.25 
 
 
198 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3502  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.25 
 
 
198 aa  168  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862204 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2704  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.7 
 
 
198 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460905  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3744  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.57 
 
 
209 aa  161  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01015  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  43.81 
 
 
200 aa  158  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000114134  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.37 
 
 
206 aa  158  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  47.28 
 
 
208 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.74 
 
 
208 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.74 
 
 
208 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.79 
 
 
207 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0760  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  45.64 
 
 
191 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  44.21 
 
 
193 aa  150  8.999999999999999e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0682  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  40.74 
 
 
204 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2527  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.06 
 
 
202 aa  149  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.330899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  43.59 
 
 
203 aa  148  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  49.38 
 
 
202 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1603  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.56 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1427  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.28 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  47.03 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1590  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  43.88 
 
 
207 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00209131  normal  0.317581 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.01 
 
 
202 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  44.26 
 
 
202 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1240  acyl-carrier-protein phosphodiesterase  42.39 
 
 
206 aa  141  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  41.84 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2533  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.25 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  44.2 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  44.2 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  44.62 
 
 
217 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  42.11 
 
 
202 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  43.09 
 
 
203 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>