101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003539 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  100 
 
 		 374 aa  776    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  70.67 
 
 		 375 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  49.87 
 
 		 385 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  32.81 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  32.21 
 
 		 392 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  31.76 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 		 705 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  28.91 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  31.68 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  27.27 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 403 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  29.87 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  26.77 
 
 		 751 aa  122  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  27.98 
 
 		 741 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.16 
 
 		 1293 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  33.65 
 
 		 814 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  32.88 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  27.94 
 
 		 754 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  27.34 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  33.65 
 
 		 783 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  26.89 
 
 		 376 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.07 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.07 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.4 
 
 		 411 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.74 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.32 
 
 		 477 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  28.02 
 
 		 411 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  30.73 
 
 		 394 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  23.18 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  31.22 
 
 		 783 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  28.27 
 
 		 443 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  29.07 
 
 		 443 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 395 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 409 aa  93.2  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 729 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  28.92 
 
 		 942 aa  89.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  23.25 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 		 378 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  23.92 
 
 		 1119 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  28.79 
 
 		 903 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  26.83 
 
 		 726 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 728 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 728 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  23.46 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  26.56 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  27.86 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 400 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  22.96 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 393 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  21.76 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  25.08 
 
 		 372 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  31.73 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  27.14 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.31 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  22.37 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  20.97 
 
 		 400 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  23.64 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  22.64 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3516  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  28.16 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  23.08 
 
 		 397 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1677  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 325 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  23.6 
 
 		 723 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  22.57 
 
 		 396 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  25.61 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  21.49 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.02 
 
 		 382 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  30.05 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>