17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003480 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003480  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000514785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02290  hypothetical protein  91.7 
 
 
265 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1040  hypothetical protein  63.81 
 
 
281 aa  358  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000182734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1579  membrane protein  46.1 
 
 
269 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1407  hypothetical protein  29.48 
 
 
258 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2060  hypothetical protein  25.81 
 
 
247 aa  99.4  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2976  hypothetical protein  27.24 
 
 
275 aa  98.6  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3315  hypothetical protein  29.36 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.607217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02070  stress-induced protein UspE  31.45 
 
 
239 aa  70.1  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0383  hypothetical protein  30.56 
 
 
228 aa  59.7  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2146  hypothetical protein  27.4 
 
 
218 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00523759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56090  hypothetical protein  26.61 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124501  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4886  hypothetical protein  25.11 
 
 
245 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.758345  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  21.05 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2073  hypothetical protein  24.31 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000612499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2098  protein of unknown function DUF975  22.97 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.274945  normal  0.188406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1900  hypothetical protein  21.59 
 
 
226 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>