291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003399 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003399  queuosine Biosynthesis QueC ATPase  100 
 
 
231 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02384  queuosine biosynthesis protein QueC  92.61 
 
 
232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0980  queuosine biosynthesis protein QueC  83.84 
 
 
231 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1965  queuosine biosynthesis protein QueC  80.09 
 
 
227 aa  388  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.681821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1854  queuosine biosynthesis protein QueC  79.19 
 
 
245 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.330643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2115  queuosine biosynthesis protein QueC  79.64 
 
 
240 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0363719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2161  queuosine biosynthesis protein QueC  77.83 
 
 
240 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0464548  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2255  queuosine biosynthesis protein QueC  78.28 
 
 
240 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.489699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2269  queuosine biosynthesis protein QueC  78.28 
 
 
240 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00296977  normal  0.263758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2015  queuosine biosynthesis protein QueC  77.43 
 
 
232 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4541  queuosine biosynthesis protein QueC  78.28 
 
 
240 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1826  ExsB protein  74.78 
 
 
230 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412081  normal  0.891566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2552  exsB protein  73.89 
 
 
233 aa  367  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312258  hitchhiker  0.0077162 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2059  queuosine biosynthesis protein QueC  77.1 
 
 
239 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0101695  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1916  queuosine biosynthesis protein QueC  77.1 
 
 
239 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.247307  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2503  queuosine biosynthesis protein QueC  75.46 
 
 
238 aa  362  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2048  ExsB protein  72.57 
 
 
232 aa  362  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.49129  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2349  exsB protein  73.01 
 
 
227 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00952166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2164  queuosine biosynthesis protein QueC  76.17 
 
 
239 aa  358  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2062  exsB protein  73.09 
 
 
227 aa  358  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1876  exsB protein  71.88 
 
 
235 aa  356  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.96525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1102  queuosine biosynthesis protein QueC  70.61 
 
 
232 aa  345  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232921  hitchhiker  0.00000230205 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3257  queuosine biosynthesis protein QueC  70.04 
 
 
231 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0480  queuosine biosynthesis protein QueC  68.28 
 
 
231 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.193162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0521  queuosine biosynthesis protein QueC  68.28 
 
 
231 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0104585  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0367  queuosine biosynthesis protein QueC  68.28 
 
 
231 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.976295  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0487  queuosine biosynthesis protein QueC  68.28 
 
 
231 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00674301  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3165  exsB protein  68.28 
 
 
231 aa  334  7.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.6328  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00396  predicted aluminum resistance protein  67.84 
 
 
231 aa  333  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3188  queuosine biosynthesis protein QueC  67.84 
 
 
231 aa  333  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0204492 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0530  queuosine biosynthesis protein QueC  67.84 
 
 
231 aa  333  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0925721  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00400  hypothetical protein  67.84 
 
 
231 aa  333  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1055  queuosine biosynthesis protein QueC  68.28 
 
 
231 aa  333  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.717702  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0514  queuosine biosynthesis protein QueC  67.4 
 
 
231 aa  331  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.698745  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0911  queuosine biosynthesis protein QueC  66.96 
 
 
242 aa  331  6e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0504  queuosine biosynthesis protein QueC  67.4 
 
 
231 aa  330  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.224809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0497  queuosine biosynthesis protein QueC  67.4 
 
 
231 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0495  queuosine biosynthesis protein QueC  67.4 
 
 
231 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0558  queuosine biosynthesis protein QueC  67.4 
 
 
231 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589492  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3085  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 
232 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000336836  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3227  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 
232 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3046  queuosine biosynthesis protein QueC  66.67 
 
 
232 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3062  exsB protein  65.2 
 
 
231 aa  325  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2870  exsB protein  64.32 
 
 
231 aa  321  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.594505  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1064  exsB protein  62.96 
 
 
220 aa  295  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.704642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1394  exsB protein  62.5 
 
 
220 aa  293  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.83856  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1256  exsB protein  61.57 
 
 
220 aa  292  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1497  exsB protein  62.04 
 
 
220 aa  291  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00251456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1458  exsB protein  62.04 
 
 
220 aa  291  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.275784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1230  aluminum resistance protein  62.04 
 
 
220 aa  291  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1232  aluminum resistance protein  62.04 
 
 
220 aa  291  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3949  exsB protein  62.04 
 
 
220 aa  291  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.431114  normal  0.0627168 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1257  exsB protein  62.04 
 
 
220 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1430  exsB protein  62.04 
 
 
220 aa  291  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191771 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1359  ExsB family transcriptional regulator  62.04 
 
 
220 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0736  exsB protein  60.47 
 
 
222 aa  288  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.52345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0752  exsB protein  60.47 
 
 
222 aa  288  4e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0894  exsB protein  61.36 
 
 
221 aa  287  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1770  exsB protein  61.01 
 
 
224 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0262  exsB protein  58.33 
 
 
238 aa  281  6.000000000000001e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0373  exsB protein  58.6 
 
 
223 aa  277  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0869  PP-loop superfamily ATPase  57.67 
 
 
217 aa  258  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000338884  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1063  exsB protein  50 
 
 
237 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1260  exsB protein  47.86 
 
 
252 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0139  exsB protein  46.93 
 
 
235 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0596  exsB protein  49.56 
 
 
242 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.906918  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2697  exsB protein  47.11 
 
 
238 aa  214  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.70556 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2795  exsB protein  45.15 
 
 
244 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0152  exsB protein  45.15 
 
 
244 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0355  exsB protein  45.15 
 
 
244 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.311751  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2363  exsB protein  45.15 
 
 
244 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2284  exsB protein  45.15 
 
 
244 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0171  exsB protein  45.15 
 
 
244 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0161  ExsB protein  45.15 
 
 
244 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.720442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0317  exsB protein  44.02 
 
 
244 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0137  exsB protein  44.77 
 
 
244 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.948426  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0258  exsB protein  49.12 
 
 
241 aa  210  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0636  exsB protein  48.9 
 
 
241 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170308  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0272  exsB protein  46.55 
 
 
236 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0441813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3116  exsB protein  43.28 
 
 
244 aa  208  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0417269  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0736  ExsB  45.11 
 
 
243 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3174  exsB protein  44.54 
 
 
244 aa  207  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3057  exsB protein  44.54 
 
 
244 aa  207  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107003  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6470  ExsB family protein  43.28 
 
 
244 aa  207  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1874  exsB protein  44.44 
 
 
249 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1125  exsB protein  46.12 
 
 
239 aa  207  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2505  ExsB  42.86 
 
 
244 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0508398  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3119  exsB protein  42.86 
 
 
244 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3135  exsB protein  42.86 
 
 
244 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.366894  normal  0.249608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6745  exsB protein  44.89 
 
 
233 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4986  exsB protein  44.3 
 
 
237 aa  205  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0043  exsB protein  42.31 
 
 
243 aa  205  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0734  ExsB  47.58 
 
 
235 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.268412  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1846  ExsB  45.69 
 
 
238 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4006  exsB protein  44.21 
 
 
235 aa  204  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000787771 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4407  ExsB  43.91 
 
 
232 aa  203  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501137  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2234  exsB protein  44.87 
 
 
239 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2744  exsB protein  44.87 
 
 
239 aa  202  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113268  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6597  exsB protein  45.74 
 
 
233 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.10243 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1877  exsB protein  49.55 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>