More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003136 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  79.25 
 
 		 216 aa  354  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 213 aa  248  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  48.79 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  47.83 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  47.83 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 206 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  46.6 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0905  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  45.63 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0826046  hitchhiker  0.00000533581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  40.47 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 213 aa  177  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 215 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  43.6 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  46.08 
 
 		 215 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6399  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2345  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499423  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0443  two component LuxR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  45.59 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1103  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 212 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.2 
 
 		 214 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  43.81 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.18 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 214 aa  167  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5079  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 217 aa  164  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.525358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6469  two component LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.53826 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7761  two component LuxR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  43.6 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3419  LuxR response regulator receiver  39.63 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 215 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  39.34 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3186  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 214 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.10411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 253 aa  160  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1385  two component LuxR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3992  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3523  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  42.59 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 224 aa  155  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0670  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4476  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.44 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 232 aa  154  6e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1981  transcriptional regulatory protein DegU, putative  41.01 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 228 aa  154  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 214 aa  154  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0788  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 218 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_002936  DET0663  LuxR family DNA-binding response regulator  39.05 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0697  LuxR family DNA-binding response regulator  39.05 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12543  Transcriptional regulator  40.89 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.204025  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  42.03 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.52 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.7 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 218 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0894  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>