More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003050 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  100 
 
 
232 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  96.96 
 
 
239 aa  454  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  78.76 
 
 
233 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  61.54 
 
 
246 aa  285  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  60.36 
 
 
225 aa  283  2e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  61.16 
 
 
241 aa  283  2e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  57.92 
 
 
237 aa  282  3e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  57.96 
 
 
228 aa  281  5e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  55.84 
 
 
653 aa  281  7e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  59.73 
 
 
252 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  60 
 
 
242 aa  280  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  57.85 
 
 
230 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  57.21 
 
 
230 aa  274  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  58.37 
 
 
244 aa  274  8e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  57.85 
 
 
242 aa  273  1e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  56.44 
 
 
248 aa  273  1e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  56.56 
 
 
224 aa  273  2e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  54.91 
 
 
236 aa  273  2e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
224 aa  272  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  58.11 
 
 
225 aa  272  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
224 aa  272  4e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  56.11 
 
 
224 aa  272  4e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  60.54 
 
 
233 aa  271  5e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2148  ABC transporter-like protein  59.19 
 
 
238 aa  271  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.021132  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 
224 aa  271  8e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  55.66 
 
 
224 aa  271  8e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  55.66 
 
 
224 aa  271  8e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  56.11 
 
 
224 aa  271  9e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  55.2 
 
 
224 aa  270  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  57.01 
 
 
226 aa  270  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  55.36 
 
 
260 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  56.47 
 
 
235 aa  269  3e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  54.75 
 
 
224 aa  268  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  53.95 
 
 
654 aa  268  6e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2776  ABC transporter related  55.8 
 
 
240 aa  268  7e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000244167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 
224 aa  268  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  54.39 
 
 
652 aa  267  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  57.21 
 
 
226 aa  267  9e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  56.76 
 
 
226 aa  267  9e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  56.82 
 
 
234 aa  266  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  61.01 
 
 
228 aa  266  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  56.31 
 
 
226 aa  266  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  56.82 
 
 
234 aa  266  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  54.87 
 
 
253 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  58.48 
 
 
230 aa  266  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  56.44 
 
 
650 aa  267  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  54.87 
 
 
253 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  56.31 
 
 
226 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  265  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 
230 aa  265  5e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  265  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  55.11 
 
 
671 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  265  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  265  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  265  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2609  ABC transporter related  56.76 
 
 
226 aa  265  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  265  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  56.31 
 
 
226 aa  265  5e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1767  ATPase  54.3 
 
 
248 aa  265  6e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.5 
 
 
647 aa  264  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  55.86 
 
 
226 aa  264  9e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  57.92 
 
 
255 aa  263  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  56.11 
 
 
266 aa  263  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  54.05 
 
 
240 aa  263  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  54.11 
 
 
676 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  57.8 
 
 
248 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  53.12 
 
 
652 aa  262  3e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  57.8 
 
 
248 aa  262  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  54.5 
 
 
233 aa  262  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  52.47 
 
 
227 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  55.16 
 
 
252 aa  261  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  53.91 
 
 
247 aa  261  5e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  54.75 
 
 
239 aa  261  5e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  57.08 
 
 
228 aa  261  5e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  52 
 
 
228 aa  261  7e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  53.78 
 
 
228 aa  261  9e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  52.91 
 
 
236 aa  260  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  54.42 
 
 
668 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  54.5 
 
 
661 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  55.66 
 
 
230 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.35089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  54.42 
 
 
668 aa  259  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  56.11 
 
 
229 aa  259  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  3.79324e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0595  ATPase  53.15 
 
 
228 aa  259  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0833962  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  52.94 
 
 
228 aa  258  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1766  ATPase  53.39 
 
 
228 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  57.47 
 
 
241 aa  257  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-10 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  52.91 
 
 
254 aa  257  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  52.19 
 
 
238 aa  257  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  51.77 
 
 
653 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06281  ABC transporter ATP-binding protein  51.09 
 
 
246 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0807317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  56.62 
 
 
228 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  57.47 
 
 
241 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  55.36 
 
 
239 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04881  ABC transporter ATP-binding protein  52.94 
 
 
235 aa  256  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  53.78 
 
 
648 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  55.05 
 
 
228 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  53.81 
 
 
236 aa  255  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  53.51 
 
 
250 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04311  ABC transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
232 aa  255  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  57.92 
 
 
241 aa  255  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>