More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003018 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  100 
 
 		 353 aa  706    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  94.05 
 
 		 353 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  80.74 
 
 		 353 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  71.67 
 
 		 353 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  59.6 
 
 		 343 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  59.09 
 
 		 337 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  56.94 
 
 		 348 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  61.03 
 
 		 349 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  61.32 
 
 		 342 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  58.17 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  57.22 
 
 		 348 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  54.67 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  55.56 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  54.67 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  54.67 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  55.37 
 
 		 348 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  55.3 
 
 		 336 aa  391  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  57.39 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  55.81 
 
 		 348 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  59.31 
 
 		 343 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  58.43 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  57.1 
 
 		 338 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  57.67 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  54.31 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  57.59 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  54.96 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  54.96 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  55.24 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  54.96 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  54.96 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  57.1 
 
 		 338 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  55.24 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  56.82 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  57.39 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  54.67 
 
 		 349 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  56.98 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  57.1 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  54.39 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  55.62 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  54.81 
 
 		 340 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  53.26 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  53.26 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  53.26 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  53.26 
 
 		 348 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  52.97 
 
 		 348 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  53.82 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  53.33 
 
 		 344 aa  342  5e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  51.02 
 
 		 339 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  50.15 
 
 		 339 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  49.85 
 
 		 339 aa  333  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  49.86 
 
 		 339 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  50.69 
 
 		 365 aa  332  7.000000000000001e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  49.86 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  50.86 
 
 		 340 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  49.44 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  50.29 
 
 		 340 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  49.43 
 
 		 342 aa  319  5e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  48.51 
 
 		 338 aa  318  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  48.21 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  47.29 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  45.83 
 
 		 356 aa  312  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  46.76 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  46.76 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  48.85 
 
 		 341 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  49.09 
 
 		 325 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  48.56 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  50.76 
 
 		 347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  48.28 
 
 		 339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  51.01 
 
 		 347 aa  298  9e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  52.25 
 
 		 324 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  59.4 
 
 		 332 aa  293  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  43.44 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  60.54 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  56.96 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  49.19 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  43.62 
 
 		 335 aa  279  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  49.19 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  48.41 
 
 		 349 aa  275  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  53.88 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  52.48 
 
 		 216 aa  205  9e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  44.24 
 
 		 165 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.25 
 
 		 625 aa  102  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1376  peptidase S49  34.86 
 
 		 295 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0974  peptidase S49  32.76 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0652949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  43.55 
 
 		 286 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32 
 
 		 640 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0909  peptidase S49  32.33 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0531296 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  42.31 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  41.94 
 
 		 286 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  31.53 
 
 		 552 aa  96.3  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  38.82 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13521  signal peptide peptidase SppA (protease IV)  35.76 
 
 		 269 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0725  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.18 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.29 
 
 		 547 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1044  putative protease transmembrane protein  32.69 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.96 
 
 		 629 aa  93.6  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.33 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  40.13 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  40.88 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  33.93 
 
 		 300 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>