146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002970 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 
321 aa  633  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  90.03 
 
 
322 aa  562  1e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  80.06 
 
 
321 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  60.34 
 
 
317 aa  363  1e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  58.22 
 
 
317 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  57.19 
 
 
317 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  57.39 
 
 
317 aa  352  6e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  56.42 
 
 
316 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  57.04 
 
 
321 aa  336  3e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  56.7 
 
 
321 aa  333  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  52.25 
 
 
324 aa  315  7e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  50.62 
 
 
319 aa  308  6e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  49.31 
 
 
324 aa  305  8e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  48.62 
 
 
322 aa  284  1e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  46.84 
 
 
325 aa  282  5e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  46.52 
 
 
325 aa  282  6e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  47.92 
 
 
323 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  47.93 
 
 
322 aa  281  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  47.77 
 
 
326 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  46.13 
 
 
343 aa  276  2e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  47.75 
 
 
323 aa  275  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  47.42 
 
 
326 aa  273  2e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.78 
 
 
327 aa  273  2e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  45.89 
 
 
329 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  44.97 
 
 
322 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  46.37 
 
 
344 aa  270  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  47.75 
 
 
323 aa  270  3e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  44.97 
 
 
323 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  44.29 
 
 
341 aa  265  6e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.79 
 
 
323 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  45.89 
 
 
321 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.48 
 
 
323 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  45.33 
 
 
341 aa  260  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.48 
 
 
323 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  43.79 
 
 
323 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.48 
 
 
323 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.48 
 
 
323 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  43.48 
 
 
323 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  45.55 
 
 
321 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  45.55 
 
 
321 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  45.55 
 
 
321 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  44.98 
 
 
341 aa  259  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  43.17 
 
 
323 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  45.21 
 
 
321 aa  256  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  40.49 
 
 
324 aa  252  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  43.25 
 
 
329 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  42.47 
 
 
325 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  41.16 
 
 
329 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  42.41 
 
 
349 aa  243  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  42.47 
 
 
349 aa  243  4e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  43.85 
 
 
320 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  41.52 
 
 
337 aa  237  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  41.98 
 
 
370 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  38.68 
 
 
338 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  39.93 
 
 
337 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  43.01 
 
 
335 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  40.2 
 
 
332 aa  218  8e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  37.15 
 
 
322 aa  218  8e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  40.2 
 
 
332 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  38.85 
 
 
584 aa  214  1e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  46.98 
 
 
270 aa  214  2e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  42.47 
 
 
320 aa  213  4e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.95 
 
 
320 aa  202  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  39.3 
 
 
319 aa  201  9e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  36.81 
 
 
334 aa  200  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  39.86 
 
 
328 aa  197  2e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  36.73 
 
 
334 aa  197  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  38.81 
 
 
330 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  34.69 
 
 
313 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  34.36 
 
 
333 aa  192  8e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  38.18 
 
 
336 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  35.2 
 
 
340 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  34.28 
 
 
331 aa  186  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.68 
 
 
347 aa  183  3e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.93 
 
 
359 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  33.79 
 
 
329 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  31.94 
 
 
328 aa  178  9e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  29.82 
 
 
329 aa  174  2e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  35.49 
 
 
331 aa  174  2e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  32.99 
 
 
327 aa  164  2e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  33.89 
 
 
331 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  31.34 
 
 
298 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  31.46 
 
 
640 aa  139  5e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.66 
 
 
344 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  27.91 
 
 
344 aa  135  1e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.45 
 
 
352 aa  125  8e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  30.3 
 
 
324 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  30 
 
 
324 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  30.45 
 
 
355 aa  121  1e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  30.69 
 
 
320 aa  122  1e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  29.75 
 
 
328 aa  117  2e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  27.12 
 
 
320 aa  114  2e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  29.76 
 
 
322 aa  113  4e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  29.21 
 
 
331 aa  113  4e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  27.41 
 
 
322 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  30.71 
 
 
384 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  28.17 
 
 
354 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  27.11 
 
 
329 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  26.74 
 
 
328 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  27.37 
 
 
326 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>