More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002944 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002944  electron transport complex protein RnfE  100 
 
 		 230 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0179212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02969  electron transport complex RsxE subunit  94.35 
 
 		 230 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0533  electron transport complex RsxE subunit  86.03 
 
 		 230 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000076694  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1867  electron transport complex RsxE subunit  78.95 
 
 		 228 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2177  electron transport complex RsxE subunit  73.8 
 
 		 231 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.206237  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1868  electron transport complex RsxE subunit  73.36 
 
 		 231 aa  340  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2358  electron transport complex RsxE subunit  70.74 
 
 		 231 aa  332  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.949569  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2071  electron transport complex RsxE subunit  70 
 
 		 232 aa  330  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1835  electron transport complex RsxE subunit  70.43 
 
 		 232 aa  329  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.521191  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2069  electron transport complex RsxE subunit  70.87 
 
 		 232 aa  328  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00102029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1906  electron transport complex RsxE subunit  70.87 
 
 		 232 aa  328  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2173  electron transport complex RsxE subunit  70.87 
 
 		 232 aa  328  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.303807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2513  electron transport complex RsxE subunit  70 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1845  electron transport complex RsxE subunit  70.43 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000056167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2278  electron transport complex RsxE subunit  70.43 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0316323  normal  0.959617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2060  electron transport complex RsxE subunit  70.43 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000214893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2107  electron transport complex RsxE subunit  70.43 
 
 		 232 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4550  electron transport complex RsxE subunit  70.43 
 
 		 232 aa  325  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2264  electron transport complex RsxE subunit  70.43 
 
 		 232 aa  325  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000442718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2194  electron transport complex RsxE subunit  66.81 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.350589  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2561  electron transport complex RsxE subunit  67.39 
 
 		 232 aa  314  9e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.428281  normal  0.0236645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2039  electron transport complex RsxE subunit  66.09 
 
 		 236 aa  314  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2970  electron transport complex RsxE subunit  68.56 
 
 		 232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2020  electron transport complex RsxE subunit  68.61 
 
 		 235 aa  308  5e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2320  electron transport complex RsxE subunit  70.62 
 
 		 235 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2235  electron transport complex RsxE subunit  67.13 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000336445 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2012  electron transport complex RsxE subunit  65.09 
 
 		 233 aa  299  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00017811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2159  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  67.12 
 
 		 230 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1900  electron transport complex RsxE subunit  65.09 
 
 		 233 aa  298  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000164726  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2248  electron transport complex RsxE subunit  69.16 
 
 		 233 aa  298  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000887941  normal  0.482499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0733  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  66.19 
 
 		 230 aa  290  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1921  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  66.2 
 
 		 231 aa  288  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1064  electron transport complex RsxE subunit  67.33 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0737938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02734  NADH-ubiquinone oxidoreductase  65.2 
 
 		 230 aa  281  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1540  electron transport complex RsxE subunit  60.62 
 
 		 255 aa  271  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174651 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2631  electron transport complex RsxE subunit  63.89 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.854749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1795  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  60.09 
 
 		 230 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.680327  hitchhiker  0.000244527 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1816  electron transport complex RsxE subunit  62.39 
 
 		 228 aa  265  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0219521  decreased coverage  0.000344211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1567  electron transport complex RsxE subunit  61.78 
 
 		 231 aa  263  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.276457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0933  electron transport complex RsxE subunit  60.18 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1841  electron transport complex RsxE subunit  61.78 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000217086  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1821  electron transport complex RsxE subunit  61.78 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2344  electron transport complex RsxE subunit  61.78 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00490465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1564  electron transport complex RsxE subunit  61.99 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.257712  normal  0.0772811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1624  electron transport complex RsxE subunit  61.99 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  normal  0.350823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1552  electron transport complex RsxE subunit  61.99 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1720  electron transport complex RsxE subunit  61.99 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.208116  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1888  electron transport complex RsxE subunit  61.99 
 
 		 230 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01602  NADH-ubiquinone oxidoreductase  63.98 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00455055  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2009  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  63.98 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206921  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1708  electron transport complex RsxE subunit  63.98 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0245386  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01592  hypothetical protein  63.98 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00529631  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1997  electron transport complex RsxE subunit  63.98 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0507177  normal  0.141925 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1031  electron transport complex RsxE subunit  59.43 
 
 		 243 aa  249  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000559383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2898  electron transport complex RsxE subunit  57.66 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.594329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18890  electron transport complex RsxE subunit  57.58 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0559311  normal  0.0454317 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1170  electron transport complex RsxE subunit  61.61 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19220  electron transport complex RsxE subunit  54.82 
 
 		 237 aa  234  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2405  electron transport complex RsxE subunit  56.77 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.561649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1399  electron transport complex RsxE subunit  58.17 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2020  electron transport complex RsxE subunit  56.22 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0723  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  57.82 
 
 		 214 aa  224  8e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.12428  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0811  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  62 
 
 		 228 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.586167  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2819  electron transport complex RsxE subunit  52.56 
 
 		 228 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1635  electron transport complex RsxE subunit  57.45 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0288  electron transport complex RsxE subunit  54.07 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3237  electron transport complex RsxE subunit  54.03 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.205198  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3197  electron transport complex RsxE subunit  49.54 
 
 		 244 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.113387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1158  electron transport complex RsxE subunit  49.77 
 
 		 230 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3197  electron transport complex RsxE subunit  45.37 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.0099576  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3936  electron transport complex RsxE subunit  45.37 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.000255424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1490  electron transport complex RsxE subunit  46.6 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1782  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  52.88 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0685  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.05 
 
 		 222 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.360116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50930  Electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  48.33 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000773379  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0677  electron transport complex RsxE subunit  47.95 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0701  electron transport complex RsxE subunit  47.95 
 
 		 200 aa  187  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.647588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0082  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  45.45 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0420224  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1319  electron transport complex RsxE subunit  44.34 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.175799  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2994  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.73 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0519  electron transport complex RsxE subunit  48.82 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0260  electron transport complex RsxE subunit  47.09 
 
 		 202 aa  178  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0390  electron transport complex RsxE subunit  46.15 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0345  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  47.72 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2827  electron transport complex RsxE subunit  45.59 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0613  electron transport complex RsxE subunit  50.49 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1241  electron transport complex RsxE subunit  45.97 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0307  electron transport complex RsxE subunit  47.55 
 
 		 196 aa  175  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1574  electron transport complex RsxE subunit  50.49 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0333623  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0531  RnfA-Nqr electron transport subunit  46.86 
 
 		 203 aa  174  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0584  electron transport complex RsxE subunit  43.78 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0696  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  44.86 
 
 		 235 aa  171  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.682533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1084  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.5 
 
 		 205 aa  171  9e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0652551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1957  electron transport complex RsxE subunit  44.86 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1158  electron transport complex RsxE subunit  45.45 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.252127 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0497  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  46.6 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000269706  hitchhiker  0.000180019 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1532  electron transport complex RsxE subunit  44.86 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0221423  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1313  electron transport complex RsxE subunit  44.98 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.860019  normal  0.240269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0214  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  41.55 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000178696  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0548  electron transport complex, RnfABCDGE type, E subunit  41.9 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.614250000000001e-24  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>