More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002940 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002940  sodium-type flagellar protein MotY precursor  100 
 
 		 293 aa  609  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000866037  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02990  hypothetical protein  91.47 
 
 		 293 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0529  sodium-type flagellar protein MotY  78.64 
 
 		 294 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708227  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1863  sodium-type flagellar protein MotY precursor  65.75 
 
 		 292 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1521  OmpA/MotB domain-containing protein  42.81 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.227378  normal  0.710419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2539  OmpA/MotB domain-containing protein  45.11 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000053368  normal  0.84389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2570  OmpA/MotB domain-containing protein  43.61 
 
 		 289 aa  248  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000124837  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2092  OmpA/MotB  43.07 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000014464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  44.36 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000819929  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2446  OmpA/MotB domain-containing protein  44.36 
 
 		 290 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000191416  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2544  OmpA/MotB domain protein  43.98 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000320218  hitchhiker  0.000000131905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1740  OmpA/MotB domain-containing protein  43.98 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000240538  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1779  OmpA/MotB domain-containing protein  43.98 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1736  OmpA/MotB domain-containing protein  43.98 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000267219  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1851  OmpA/MotB domain-containing protein  41.26 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000146772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1601  OmpA/MotB domain-containing protein  43.61 
 
 		 289 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000019607  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2738  OmpA/MotB domain-containing protein  42.48 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00376202  hitchhiker  0.000469935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1400  OmpA/MotB  40.71 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000117865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1457  OmpA/MotB domain-containing protein  41.64 
 
 		 289 aa  239  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.298949  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02741  sodium-type flagellar protein MotY  40.48 
 
 		 290 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3471  sodium-type flagellar protein MotY  39.65 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1398  OmpA/MotB  39.66 
 
 		 289 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1532  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 296 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975631  normal  0.253081 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3034  hypothetical protein  28.67 
 
 		 294 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2892  hypothetical protein  28.67 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2427  putative outer membrane protein  29.07 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.831688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  29.53 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  28.74 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2504  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 		 313 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  29.37 
 
 		 317 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1455  OmpA/MotB domain-containing protein  25.32 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.935476  normal  0.139769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753.2  sodium-type flagellar protein MotY  43.22 
 
 		 122 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  25.8 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  25.44 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1393  OmpA/MotB domain-containing protein  26.89 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.567288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  26.59 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  26.4 
 
 		 324 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001183  putative sodium-type flagellar protein MotY precursor  25.68 
 
 		 339 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  25.52 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  24.3 
 
 		 280 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0080  hypothetical protein  25.77 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.580583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04970  hypothetical protein  22.83 
 
 		 350 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  35.86 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49900  hypothetical protein  30.37 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.482093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  40.21 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3567  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  46.58 
 
 		 569 aa  70.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  36 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  34.51 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  34.51 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  35.78 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 679 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  36.45 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  35.78 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  37 
 
 		 498 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  47.89 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  32.45 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  42.27 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  42.53 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  36.84 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  31.86 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  46.48 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 167 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  38.95 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32.17 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0086  OmpA/MotB domain-containing protein  23.57 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.97 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  42.35 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  39.76 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  27.88 
 
 		 544 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3084  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000180513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15220  outer membrane protein, OmpA/MotB family  37.89 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  35.04 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  35.4 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  34.91 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  46.67 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  42.67 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  40.23 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4250  hypothetical protein  38.95 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  38.46 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  30.56 
 
 		 1026 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  34.07 
 
 		 219 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  35.56 
 
 		 219 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 263 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  36.84 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  40.91 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  36.84 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>