94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002895 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002895  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  124  4e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03079  hypothetical protein  86.67 
 
 
60 aa  110  4e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0575  hypothetical protein  83.33 
 
 
83 aa  108  2e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.79653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1006  hypothetical protein  71.67 
 
 
83 aa  95.9  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4025  hypothetical protein  63.33 
 
 
83 aa  82.4  2e-15  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90654  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2091  protein of unknown function UPF0153  60 
 
 
83 aa  79  2e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0939789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2041  hypothetical protein  61.67 
 
 
83 aa  79.3  2e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0055  hypothetical protein  65 
 
 
83 aa  78.6  3e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0585048  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3703  hypothetical protein  61.67 
 
 
83 aa  77.8  5e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0024  hypothetical protein  51.67 
 
 
111 aa  77.4  6e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.643879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4222  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  77.4  6e-14  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3811  hypothetical protein  61.67 
 
 
84 aa  77  7e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.214494  normal  0.3125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2875  hypothetical protein  60 
 
 
88 aa  77.4  7e-14  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0044  hypothetical protein  63.33 
 
 
83 aa  77  8e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0038  hypothetical protein  61.67 
 
 
84 aa  77  8e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304383  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2609  hypothetical protein  56.67 
 
 
88 aa  76.6  1e-13  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0040  hypothetical protein  61.67 
 
 
84 aa  76.6  1e-13  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.140935  hitchhiker  0.000251454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0043  protein of unknown function UPF0153  51.67 
 
 
88 aa  76.3  1e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0042  hypothetical protein  60 
 
 
62 aa  76.3  1e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0871438  unclonable  1.16494e-05 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0046  hypothetical protein  61.67 
 
 
84 aa  75.9  2e-13  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  7.39222e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4337  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  75.1  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4110  hypothetical protein  56.67 
 
 
84 aa  75.1  3e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0038  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  75.1  3e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0042  protein of unknown function UPF0153  60 
 
 
84 aa  74.7  4e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  2.33524e-12 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4882  hypothetical protein  64.91 
 
 
83 aa  74.3  5e-13  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0035  hypothetical protein  60 
 
 
84 aa  74.3  5e-13  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2476  hypothetical protein  55 
 
 
98 aa  73.6  8e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44090  putative Fe-S-cluster oxidoreductase  53.33 
 
 
84 aa  72.8  1e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0356  hypothetical protein  56.67 
 
 
84 aa  72.4  2e-12  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0447585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2988  hypothetical protein  56.67 
 
 
87 aa  72.4  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.76291e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3749  Fe-S-cluster domain-containing protein  55 
 
 
134 aa  72  2e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0699  hypothetical protein  51.67 
 
 
63 aa  72.8  2e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00386805  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4475  hypothetical protein  58.33 
 
 
83 aa  72  3e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  1.50782e-06  decreased coverage  2.28641e-09 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3747  protein of unknown function UPF0153  58.33 
 
 
86 aa  72  3e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0803  hypothetical protein  53.33 
 
 
70 aa  71.6  3e-12  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0071  hypothetical protein  53.33 
 
 
85 aa  71.2  4e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0792  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  71.2  4e-12  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4019  hypothetical protein  53.33 
 
 
122 aa  71.2  5e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.561383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3519  hypothetical protein  56.67 
 
 
84 aa  70.5  7e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2765  hypothetical protein  51.67 
 
 
84 aa  70.5  8e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.443935  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0608  protein of unknown function UPF0153  51.67 
 
 
85 aa  69.7  1e-11  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00802731  normal  0.548911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0436  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  69.7  1e-11  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.452885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0649  protein of unknown function UPF0153  51.67 
 
 
85 aa  69.7  1e-11  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.572845  normal  0.0906583 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0915  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  69.7  1e-11  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0885  hypothetical protein  53.33 
 
 
105 aa  69.3  1e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.488999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0353  protein of unknown function UPF0153  48.33 
 
 
85 aa  69.3  2e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0115675  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4193  hypothetical protein  48.33 
 
 
62 aa  69.3  2e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65496e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0856  hypothetical protein  55 
 
 
94 aa  68.6  3e-11  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0603  hypothetical protein  55 
 
 
98 aa  68.2  4e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4195  hypothetical protein  55 
 
 
84 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0876839  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1658  hypothetical protein  55 
 
 
84 aa  68.2  4e-11  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0686  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  66.2  1e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3121  protein of unknown function UPF0153  53.33 
 
 
109 aa  66.6  1e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2510  hypothetical protein  51.67 
 
 
83 aa  66.2  1e-10  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0872529  normal  0.87408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0755  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  66.6  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3767  hypothetical protein  53.33 
 
 
84 aa  66.2  2e-10  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.193087  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1510  hypothetical protein  48.33 
 
 
109 aa  65.9  2e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0423377  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2359  protein YeiW  51.67 
 
 
92 aa  65.5  2e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.42497e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0378  protein of unknown function UPF0153  51.67 
 
 
90 aa  65.5  3e-10  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2170  hypothetical protein  48.33 
 
 
109 aa  65.1  3e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.298759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2040  hypothetical protein  48.33 
 
 
110 aa  65.1  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.321846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3673  protein of unknown function UPF0153  48.33 
 
 
84 aa  65.1  3e-10  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2573  hypothetical protein  48.33 
 
 
109 aa  65.1  3e-10  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3059  hypothetical protein  48.33 
 
 
109 aa  65.1  3e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0740  hypothetical protein  48.33 
 
 
110 aa  65.1  3e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3094  hypothetical protein  48.33 
 
 
109 aa  65.1  3e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2404  hypothetical protein  51.67 
 
 
84 aa  65.1  3e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.594721  hitchhiker  3.12382e-05 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3121  proteinase inhibitor  48.33 
 
 
146 aa  64.7  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3788  hypothetical protein  49.15 
 
 
86 aa  64.3  6e-10  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000190416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03942  proteinase inhibitor  48.33 
 
 
62 aa  64.3  6e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0272  hypothetical protein  51.67 
 
 
93 aa  63.9  7e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2450  protein YeiW  50 
 
 
84 aa  63.5  9e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0381641  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1932  hypothetical protein  46.67 
 
 
95 aa  63.2  1e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2002  hypothetical protein  48.33 
 
 
85 aa  60.8  5e-09  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.786219  normal  0.232569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29830  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  60.8  6e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2192  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  60.1  1e-08  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.583182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2707  hypothetical protein  45 
 
 
99 aa  60.1  1e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0049  hypothetical protein  46.67 
 
 
87 aa  59.3  2e-08  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3307  hypothetical protein  41.67 
 
 
128 aa  57.8  4e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161455  normal  0.0250777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3912  hypothetical protein  48.21 
 
 
79 aa  58.2  4e-08  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02059  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  56.6  1e-07  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02100  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  56.6  1e-07  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2318  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  56.6  1e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00260934  hitchhiker  0.00124258 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1487  protein of unknown function UPF0153  41.67 
 
 
84 aa  56.6  1e-07  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.07219e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1477  hypothetical protein  41.67 
 
 
84 aa  55.8  2e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000628609  hitchhiker  1.39061e-05 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2775  hypothetical protein  43.33 
 
 
84 aa  53.9  6e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2696  hypothetical protein  43.33 
 
 
84 aa  53.9  6e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1512  hypothetical protein  42.62 
 
 
85 aa  49.7  1e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.93354 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0791  hypothetical protein  42 
 
 
73 aa  48.9  2e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.69058e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3235  hypothetical protein  38.33 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04615e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1921  protein of unknown function UPF0153  38.33 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00522326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1650  hypothetical protein  38.33 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0564934  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2331  protein of unknown function UPF0153  35 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2428  protein of unknown function UPF0153  36.67 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>