133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002820 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  100 
 
 
623 aa  1246  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  51.99 
 
 
686 aa  541  1e-152  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  63.95 
 
 
674 aa  181  3e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2303  polar flagellar hook-length control protein FliK  50.86 
 
 
407 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  42.52 
 
 
579 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  42.52 
 
 
585 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  41.73 
 
 
586 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  41.73 
 
 
527 aa  94.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  44.44 
 
 
491 aa  94  8e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  41.41 
 
 
508 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  37.3 
 
 
544 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  40 
 
 
568 aa  92  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  37.6 
 
 
593 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  40.48 
 
 
495 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  34.01 
 
 
768 aa  88.2  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  40.48 
 
 
512 aa  88.2  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  36.16 
 
 
717 aa  85.9  2e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3042  flagellar hook-length control protein  41.35 
 
 
723 aa  85.1  4e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  34.46 
 
 
718 aa  84.7  4e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  33.89 
 
 
428 aa  84.3  5e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  51.43 
 
 
702 aa  84  8e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  37.76 
 
 
609 aa  82.4  2e-14  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  51.43 
 
 
537 aa  82.4  3e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  37.86 
 
 
567 aa  81.3  4e-14  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  80.1  1e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  42.86 
 
 
408 aa  77.8  6e-13  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  36.7 
 
 
485 aa  74.3  5e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  40.26 
 
 
660 aa  73.2  1e-11  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1163  flagellar hook-length control protein  31.72 
 
 
364 aa  73.2  1e-11  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.193048  normal  0.0180974 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  33.59 
 
 
324 aa  71.2  5e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  30.46 
 
 
487 aa  69.3  2e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  29.66 
 
 
434 aa  68.6  3e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  29.66 
 
 
434 aa  68.6  3e-10  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  36.47 
 
 
360 aa  67.8  5e-10  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4361  flagellar hook-length control protein  37.23 
 
 
421 aa  65.5  3e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1506  flagellar hook-length control protein  37.23 
 
 
421 aa  65.5  3e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal  0.0562001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  29.91 
 
 
414 aa  65.5  3e-09  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1544  flagellar hook-length control protein  38.3 
 
 
453 aa  64.7  5e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.213285  normal  0.574566 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1651  hypothetical protein  29.91 
 
 
420 aa  64.7  5e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3686  flagellar hook-length control protein  37.78 
 
 
435 aa  63.9  7e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.373199  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3922  flagellar hook-length control protein  37.78 
 
 
421 aa  63.9  8e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24180  Flagellar hook-length control protein  28.19 
 
 
461 aa  63.9  8e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0290673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  24.57 
 
 
480 aa  63.9  8e-09  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1989  flagellar hook-length control protein  35.63 
 
 
394 aa  62.4  2e-08  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  28.7 
 
 
478 aa  61.6  5e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  33.94 
 
 
431 aa  61.2  5e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  30.23 
 
 
389 aa  60.8  6e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0493  flagellar hook-length control protein  31.4 
 
 
460 aa  60.5  8e-08  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  36.49 
 
 
580 aa  58.9  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  32.89 
 
 
523 aa  59.3  2e-07  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1966  flagellar hook-length control protein FliK  35.56 
 
 
474 aa  58.5  3e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.471768  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3649  flagellar hook-length control protein  29.7 
 
 
525 aa  58.5  4e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.609424  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4726  flagellar hook-length control protein  29.7 
 
 
525 aa  58.5  4e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3449  flagellar hook-length control protein  35.56 
 
 
467 aa  58.5  4e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  40.28 
 
 
450 aa  58.2  5e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0575  flagellar hook-length control protein  28.81 
 
 
552 aa  57.8  6e-07  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  40.28 
 
 
452 aa  57.4  7e-07  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  29.85 
 
 
430 aa  57.4  8e-07  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  27.83 
 
 
335 aa  57.4  9e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  25.53 
 
 
504 aa  55.8  2e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2187  flagellar hook-length control protein  31.07 
 
 
495 aa  54.7  4e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3635  flagellar hook-length control protein  32.99 
 
 
438 aa  54.7  5e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.225852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  31.25 
 
 
443 aa  54.7  5e-06  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0714  flagellar hook-length control protein  36.56 
 
 
369 aa  54.7  6e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1973  flagellar hook-length control protein  25.87 
 
 
373 aa  54.3  6e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  28.75 
 
 
455 aa  54.3  7e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  28.75 
 
 
458 aa  53.5  1e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1960  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 
456 aa  53.5  1e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  28.75 
 
 
458 aa  53.9  1e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0195  flagellar hook-length control protein, putative  30.38 
 
 
465 aa  53.5  1e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  32.5 
 
 
490 aa  53.1  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2980  flagellar hook-length control protein  27.5 
 
 
455 aa  52.8  2e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3069  flagellar hook-length control protein  27.5 
 
 
452 aa  52.4  2e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0395  flagellar hook-length control protein  27.06 
 
 
516 aa  52.4  2e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.475932  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  28.75 
 
 
466 aa  53.1  2e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2455  flagellar hook-length control protein  27.5 
 
 
452 aa  52.4  2e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0513152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  26.97 
 
 
455 aa  52.8  2e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3583  flagellar hook-length control protein  29.01 
 
 
334 aa  52.8  2e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  28.75 
 
 
466 aa  53.1  2e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2403  flagellar hook-length control protein  26.36 
 
 
580 aa  52.8  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1713  hypothetical protein  30.53 
 
 
592 aa  52  3e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2039  flagellar hook-length control protein  31.87 
 
 
383 aa  52  3e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3088  flagellar hook-length control protein  27.5 
 
 
456 aa  52  3e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0855  flagellar hook-length control protein-like protein  29.27 
 
 
723 aa  51.2  6e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2952  flagellar hook-length control protein  30.61 
 
 
407 aa  50.8  7e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3952  flagellar hook-length control protein  30.65 
 
 
395 aa  50.8  7e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.253491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1760  flagellar hook-length control protein  29.91 
 
 
517 aa  50.4  8e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0412  flagellar hook-length control protein, putative  28.75 
 
 
677 aa  50.4  9e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.711006  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3076  flagellar hook-length control protein  32.26 
 
 
436 aa  50.4  9e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5119  flagellar hook-length control protein  34.52 
 
 
446 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0145364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3802  flagellar hook-length control protein  32.26 
 
 
436 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101066  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0059  flagellar hook-length control protein  30.48 
 
 
390 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3066  flagellar hook-length control protein  26.25 
 
 
449 aa  50.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  29.11 
 
 
503 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  28.44 
 
 
447 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3451  flagellar hook-length control protein  35.94 
 
 
393 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1880  putative flagellar hook length determination protein  35.06 
 
 
542 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04953  flagellar hook-length control protein  25.64 
 
 
351 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001169  flagellar hook-length control protein FliK  26.61 
 
 
357 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.272814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0259  flagellar hook-length control protein  25.69 
 
 
658 aa  47.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>