More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002806 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  100 
 
 
376 aa  752    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  94.15 
 
 
376 aa  712    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  82.18 
 
 
376 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  78.51 
 
 
377 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  78.25 
 
 
377 aa  581  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  77.19 
 
 
377 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  77.19 
 
 
377 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  71.88 
 
 
377 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  72.94 
 
 
377 aa  546  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  72.87 
 
 
402 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  71.62 
 
 
375 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  67.37 
 
 
378 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  66.58 
 
 
377 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  65.52 
 
 
377 aa  492  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  66.58 
 
 
377 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  63.56 
 
 
385 aa  490  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  65.34 
 
 
379 aa  490  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  64.84 
 
 
384 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  66.67 
 
 
379 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  64.32 
 
 
384 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  62.77 
 
 
378 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  49.73 
 
 
374 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  49.47 
 
 
374 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  50.62 
 
 
393 aa  330  2e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  45.9 
 
 
387 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  41.21 
 
 
395 aa  264  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  41.36 
 
 
405 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  40.79 
 
 
392 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  43.62 
 
 
319 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  43.47 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  39.04 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  38.26 
 
 
375 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  38.94 
 
 
404 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  38.73 
 
 
390 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  38.73 
 
 
390 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  39.74 
 
 
380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  65.87 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  36.54 
 
 
383 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  61.54 
 
 
484 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  39.53 
 
 
376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  61.03 
 
 
485 aa  219  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  67.7 
 
 
468 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  40.16 
 
 
274 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  63.8 
 
 
482 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  64.42 
 
 
481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.47 
 
 
437 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  62.36 
 
 
517 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  37.98 
 
 
356 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  60.48 
 
 
492 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  34.29 
 
 
420 aa  208  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  37.21 
 
 
369 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  37.21 
 
 
369 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  60.11 
 
 
516 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  62.73 
 
 
687 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  36.17 
 
 
327 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  38.54 
 
 
386 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  37.44 
 
 
390 aa  203  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  36.63 
 
 
404 aa  202  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  59.63 
 
 
488 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  33.69 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  35.5 
 
 
386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  36.62 
 
 
373 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  36.47 
 
 
412 aa  196  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  35.37 
 
 
379 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  34.34 
 
 
387 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  56.55 
 
 
494 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  52.91 
 
 
271 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  59.01 
 
 
271 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  52.91 
 
 
271 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  59.01 
 
 
271 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  51.85 
 
 
272 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  51.85 
 
 
272 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  52.91 
 
 
271 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  52.91 
 
 
271 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  34.84 
 
 
389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  54.24 
 
 
475 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  32.74 
 
 
384 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  32.74 
 
 
384 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  53.67 
 
 
475 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  59.26 
 
 
274 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  58.02 
 
 
270 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  52.15 
 
 
273 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  59.01 
 
 
483 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  50.8 
 
 
273 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  59.01 
 
 
294 aa  186  7e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  55.09 
 
 
490 aa  186  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  56.71 
 
 
273 aa  185  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  54.26 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  33.93 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  57.41 
 
 
275 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  55.42 
 
 
493 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  50.26 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  56.79 
 
 
275 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  51.06 
 
 
273 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  50.52 
 
 
506 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  35.7 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  55.25 
 
 
272 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  36.49 
 
 
372 aa  182  8.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  55.23 
 
 
272 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>