296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002786 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  93.05 
 
 
190 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  75.41 
 
 
186 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  59.28 
 
 
199 aa  230  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  59.28 
 
 
199 aa  228  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.4 
 
 
202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  55.44 
 
 
202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  56.41 
 
 
200 aa  211  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.96 
 
 
199 aa  207  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.89 
 
 
200 aa  207  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.38 
 
 
200 aa  204  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  54.92 
 
 
197 aa  205  4e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  54.92 
 
 
197 aa  205  4e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  55.96 
 
 
197 aa  204  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  55.96 
 
 
197 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.37 
 
 
209 aa  204  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  54.4 
 
 
200 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  55.21 
 
 
198 aa  200  9e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  57.81 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  54.4 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  54.17 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.08 
 
 
198 aa  198  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  58.33 
 
 
205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  53.65 
 
 
212 aa  197  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  54.08 
 
 
200 aa  197  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.17 
 
 
198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  52.04 
 
 
205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  53.61 
 
 
200 aa  195  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  53.89 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  52.82 
 
 
202 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  52.82 
 
 
202 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  52.82 
 
 
202 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  52.82 
 
 
202 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  52.82 
 
 
202 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  52.82 
 
 
202 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  52.31 
 
 
201 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.79 
 
 
206 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  54.26 
 
 
206 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  52.31 
 
 
201 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  53.09 
 
 
687 aa  193  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.64 
 
 
198 aa  193  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  52.58 
 
 
201 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  53.12 
 
 
202 aa  193  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.26 
 
 
206 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.26 
 
 
206 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.79 
 
 
201 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  51.79 
 
 
201 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  54.59 
 
 
203 aa  191  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  51.3 
 
 
199 aa  191  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  54.59 
 
 
206 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  51.32 
 
 
197 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.28 
 
 
201 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.05 
 
 
206 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.03 
 
 
220 aa  188  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  50.78 
 
 
197 aa  187  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  49.22 
 
 
209 aa  187  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  49.24 
 
 
205 aa  186  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.52 
 
 
203 aa  185  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  51.3 
 
 
197 aa  185  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  53.33 
 
 
200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  50 
 
 
218 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  50.26 
 
 
205 aa  177  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0537  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.78 
 
 
205 aa  177  1e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  53.09 
 
 
202 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  49.22 
 
 
199 aa  175  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  49.22 
 
 
199 aa  174  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  54.44 
 
 
184 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 
200 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  39.8 
 
 
200 aa  148  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  38.27 
 
 
197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
200 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  38.07 
 
 
200 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
200 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
200 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  40.82 
 
 
199 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  39.49 
 
 
201 aa  141  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  39.9 
 
 
201 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0396  flavoprotein WrbA  39.7 
 
 
212 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  37.06 
 
 
200 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  37.81 
 
 
203 aa  137  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 
200 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  38.89 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1256  flavoprotein WrbA  37.81 
 
 
204 aa  135  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  38.78 
 
 
199 aa  135  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  38.78 
 
 
199 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0771  TrpR binding protein WrbA  37.81 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  37.5 
 
 
204 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  40.61 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  38 
 
 
204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  40.48 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  36.82 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2368  TrpR binding protein WrbA  39.09 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  35.32 
 
 
204 aa  130  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  37.24 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2843  TrpR binding protein WrbA  37.76 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  35.53 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2234  flavoprotein WrbA  38.42 
 
 
206 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  38.58 
 
 
199 aa  128  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>