More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002765 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  100 
 
 		 104 aa  206  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  90.38 
 
 		 104 aa  186  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  76.92 
 
 		 107 aa  156  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  58.1 
 
 		 104 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  63.46 
 
 		 103 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  50.96 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  50.96 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  50.96 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  48.08 
 
 		 129 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  52.88 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  43.88 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  59.6 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  48.35 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  47.57 
 
 		 318 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  49.02 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  42.86 
 
 		 110 aa  90.5  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  53.85 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  54.32 
 
 		 98 aa  88.2  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  60 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  47.5 
 
 		 108 aa  84.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  44.86 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  44.55 
 
 		 106 aa  84.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  46.32 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  52.81 
 
 		 220 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  45.78 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  41.28 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  39.62 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  41.51 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  46 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  43.88 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  40.57 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  37.74 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  37.04 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  41.67 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  46.43 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  41.67 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 221 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  47.73 
 
 		 205 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  44.34 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  47.73 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  42.68 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  37.96 
 
 		 205 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  37.96 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  37.96 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  44.23 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  44.87 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  40.24 
 
 		 266 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  46.43 
 
 		 198 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  46.15 
 
 		 200 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  45.68 
 
 		 205 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  40.82 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  38.1 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  44.87 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  41.9 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  37 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  43.66 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  41.24 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  40.7 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  43.24 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 287 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  37.11 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  45.98 
 
 		 153 aa  67  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  38.94 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  39.76 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  43.42 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  44.05 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  42.35 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  36.7 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  43.66 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  40.79 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  43.66 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  40.18 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  40.18 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  40.22 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  38.32 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  37 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  35 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  38.96 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  40.4 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  43.04 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  43.66 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  40.62 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  39.76 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  40.45 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  42.27 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  43.02 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>