164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002698 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  411  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  83.84 
 
 
198 aa  354  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  55.26 
 
 
193 aa  215  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  38.1 
 
 
188 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.69 
 
 
183 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  47.2 
 
 
183 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.69 
 
 
183 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  44.69 
 
 
183 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.45 
 
 
185 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.45 
 
 
185 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.44 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  45.57 
 
 
183 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.34 
 
 
183 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.19 
 
 
196 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  41.18 
 
 
184 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.02 
 
 
182 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  37.06 
 
 
171 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.98 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.55 
 
 
196 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.68 
 
 
190 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  37.68 
 
 
202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.29 
 
 
193 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  31.22 
 
 
194 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  30.16 
 
 
191 aa  95.1  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  37.04 
 
 
194 aa  93.2  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  35.53 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  32.6 
 
 
192 aa  91.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  33.86 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.49 
 
 
214 aa  90.1  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  30.77 
 
 
200 aa  89.4  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
191 aa  87.8  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.35 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.44 
 
 
209 aa  86.3  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  34.55 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  30.57 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  27.51 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  41.54 
 
 
196 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  32.43 
 
 
220 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  28.04 
 
 
191 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  29.23 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  27.51 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  39.45 
 
 
111 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  29.56 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  30.65 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  27.51 
 
 
191 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.06 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  38.19 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  31.49 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  33.14 
 
 
217 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.9 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  33.53 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  25.93 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  28.25 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  31.94 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.65 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.64 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  31.32 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  30.77 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.77 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  40.95 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.77 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.42 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.42 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  29.82 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  32.04 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.87 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.86 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  29.7 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  41.67 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  41.67 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.92 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  29.95 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.96 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  29.67 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.95 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.95 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  39.09 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  28.02 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.92 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  28.75 
 
 
241 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  41.11 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  41.11 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  30.77 
 
 
217 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  33.04 
 
 
213 aa  61.6  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.69 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  29.76 
 
 
216 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  38.89 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>