179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002662 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  100 
 
 		 386 aa  790    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  96.11 
 
 		 386 aa  769    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  77.66 
 
 		 405 aa  628  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  76.5 
 
 		 387 aa  623  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  65.01 
 
 		 385 aa  521  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  65.08 
 
 		 382 aa  514  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  65.08 
 
 		 382 aa  514  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  63.49 
 
 		 382 aa  511  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  64.81 
 
 		 382 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  65.08 
 
 		 382 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  65.08 
 
 		 382 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  65.08 
 
 		 382 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  63.23 
 
 		 382 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  63.23 
 
 		 382 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  64.55 
 
 		 382 aa  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  63.49 
 
 		 382 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  63.49 
 
 		 382 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  63.49 
 
 		 382 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  67.02 
 
 		 383 aa  504  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  63.95 
 
 		 383 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  65.27 
 
 		 387 aa  495  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  65.62 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  62.99 
 
 		 383 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  60.69 
 
 		 389 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  63.42 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  63.42 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  63.42 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  60.36 
 
 		 387 aa  478  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  53.03 
 
 		 385 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  52.77 
 
 		 409 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  54.67 
 
 		 379 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  51.3 
 
 		 388 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  50.79 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  51.32 
 
 		 388 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  48.7 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  50.68 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  48.58 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  47.72 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  47.77 
 
 		 391 aa  346  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  47.01 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  48.16 
 
 		 391 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  44.1 
 
 		 398 aa  332  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  42.45 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  42.45 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  42.45 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  42.45 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  41.93 
 
 		 381 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  41.15 
 
 		 381 aa  319  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  42.86 
 
 		 382 aa  318  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  46.42 
 
 		 403 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  40.78 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  41.15 
 
 		 381 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  40.89 
 
 		 381 aa  315  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  45.28 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  43.38 
 
 		 387 aa  312  6.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  43.62 
 
 		 404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  40 
 
 		 387 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3668  galactokinase  39.16 
 
 		 380 aa  300  4e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  44.66 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  39.48 
 
 		 387 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  46.61 
 
 		 390 aa  292  8e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  42.16 
 
 		 386 aa  292  8e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  36.98 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  42.19 
 
 		 385 aa  289  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  42.86 
 
 		 392 aa  289  6e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  43.47 
 
 		 372 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  38.4 
 
 		 392 aa  282  7.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  40.31 
 
 		 388 aa  278  9e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  43.6 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  40.57 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  40.97 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  41.09 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  42.11 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  41.47 
 
 		 392 aa  275  7e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  39.64 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  40.21 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  42.86 
 
 		 376 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  40.79 
 
 		 359 aa  266  4e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  38.4 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  40.16 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  38.89 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  39.59 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  36.52 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  40.05 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  37.22 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  39.23 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  38.92 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  40.92 
 
 		 373 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  39.68 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  40.36 
 
 		 395 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  35.97 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  40 
 
 		 358 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  40.05 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  37.21 
 
 		 383 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  39.43 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  37.5 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  41.26 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  38.68 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3451  galactokinase  36.17 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  38.8 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>