More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002624 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002624  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  320  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03382  hypothetical protein  85.92 
 
 
144 aa  259  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0189  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  70 
 
 
161 aa  216  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0612  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  62.67 
 
 
148 aa  200  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3230  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.14 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2151  putative acetyltransferase  40.56 
 
 
155 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.1 
 
 
152 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0188  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.86 
 
 
155 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.97 
 
 
147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4775  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.71 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42420  acetylating ribosomal protein, RimI  41.3 
 
 
141 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3505  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.73 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3634  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.73 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61880  peptide n-acetyltransferase RimI  39.58 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.355527  normal  0.0211916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.29 
 
 
151 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0975  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.66 
 
 
149 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5385  peptide n-acetyltransferase RimI  40 
 
 
150 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4460  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.22 
 
 
172 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00479194  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1731  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.58 
 
 
156 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.71 
 
 
150 aa  105  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.89 
 
 
151 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4570  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  44.37 
 
 
157 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0697  acetyltransferase  38.89 
 
 
151 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1798  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.91 
 
 
156 aa  104  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3447  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.86 
 
 
147 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.58 
 
 
157 aa  104  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.86 
 
 
147 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.16 
 
 
147 aa  103  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.29 
 
 
151 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.873568  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.22 
 
 
180 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.86 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3941  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  39.16 
 
 
158 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1114  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.93 
 
 
168 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3290  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.16 
 
 
158 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.556647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03190  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.6 
 
 
160 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.86 
 
 
151 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.729447  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  41.1 
 
 
150 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0413  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  42.07 
 
 
153 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40 
 
 
148 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  41.1 
 
 
150 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1048  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  41.1 
 
 
150 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.070791  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2855  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.16 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2877  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.75 
 
 
165 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0857  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.86 
 
 
150 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1574  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.59 
 
 
164 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.26 
 
 
148 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.58 
 
 
167 aa  97.8  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0553  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.93 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.927213  hitchhiker  0.000465123 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3157  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.52 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000750548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2256  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.86 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.6 
 
 
162 aa  94.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0302  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.14 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275803  normal  0.0377185 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.28 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3845  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.75 
 
 
164 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3461  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.42 
 
 
187 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2002  putative acetyltransferase  39.33 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3325  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.31 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0838  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.53 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.76 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02800  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.52 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3325  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.1 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4620  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.75 
 
 
167 aa  92  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2464  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2520  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.86 
 
 
165 aa  91.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3229  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1356  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0397036  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2083  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
165 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0325128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
191 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0126129  hitchhiker  0.000306087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.69 
 
 
160 aa  90.5  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.13 
 
 
168 aa  90.5  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000312677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1396  30S ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.85 
 
 
188 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.547369 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.58 
 
 
148 aa  90.1  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2609  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.74 
 
 
491 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2076  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.89 
 
 
166 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1364  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.51 
 
 
164 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1349  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.93 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2152  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.73 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011584  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1724  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38.36 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1233  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.19 
 
 
165 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262778  normal  0.168015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3283  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.76 
 
 
191 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.33549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1945  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.19 
 
 
166 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3716  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.41 
 
 
151 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0086441  hitchhiker  0.00862742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4914  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.16 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0583375  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4966  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.16 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4972  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.16 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4879  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.16 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00181448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4811  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.16 
 
 
98 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345894  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1458  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1525  hypothetical protein  33.33 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.78 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.05 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>