More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002577 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0140  putative phosphoglucomutase/phosphomannomutase  89.57 
 
 
470 aa  854    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2585  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  83.62 
 
 
470 aa  808    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002577  GlcNAc phosphomutase  100 
 
 
470 aa  961    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03432  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  96.6 
 
 
470 aa  917    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3855  phosphomannomutase  54.26 
 
 
474 aa  556  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28260  phosphomannomutase  50.21 
 
 
473 aa  494  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1054  Glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase., Phosphoglucomutase  41.65 
 
 
733 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4110  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  40.25 
 
 
470 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036282 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2089  phosphomannomutase  39.53 
 
 
467 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.631588  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0221  phosphoglucomutase  39.02 
 
 
471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3100  phosphoglucomutase  38.76 
 
 
486 aa  338  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4381  phosphoglucomutase  37.26 
 
 
469 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000631194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0135  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.79 
 
 
469 aa  326  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226581  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2040  Phosphomannomutase  37.53 
 
 
467 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0022355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1132  Phosphoglucomutase  38.27 
 
 
470 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.301327  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3418  phosphoglucomutase  35.78 
 
 
478 aa  324  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3319  Phosphoglucomutase  37.8 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1967  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  38.17 
 
 
466 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1311  phosphomannomutase ManB  35.61 
 
 
473 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81653e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2567  phosphoglucosamine mutase  36.92 
 
 
488 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0510  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.97 
 
 
475 aa  313  5.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4823  phosphoglucomutase  37.37 
 
 
471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1737  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  36.25 
 
 
475 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.148942  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1767  phosphoglucosamine mutase  37.39 
 
 
475 aa  306  6e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3321  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.03 
 
 
469 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1567  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.03 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000749576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2649  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  36.03 
 
 
474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2013  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.96 
 
 
472 aa  296  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0108375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1831  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.75 
 
 
472 aa  295  8e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000124706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1605  Phosphoglucomutase  34.68 
 
 
472 aa  290  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000165819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0372  Phosphoglucosamine mutase  36.03 
 
 
474 aa  290  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4050  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.46 
 
 
469 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1751  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  34.97 
 
 
467 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3964  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  35.41 
 
 
469 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000701668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1752  Phosphoglucomutase  38.58 
 
 
463 aa  288  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2017  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.76 
 
 
472 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000060131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0990  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.33 
 
 
472 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000661724  normal  0.0347081 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0794  Phosphomannomutase  35.47 
 
 
474 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0486  phosphomannomutase  35.7 
 
 
414 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.504312  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0077  Phosphomannomutase  34.34 
 
 
460 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_451  phosphomannomutase  34.73 
 
 
409 aa  256  9e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0496363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1740  phosphoglucomutase  33.98 
 
 
460 aa  253  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0251978 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0991  Phosphomannomutase  33.9 
 
 
458 aa  251  1e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0474  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.48 
 
 
460 aa  249  6e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0411  Phosphomannomutase  31.91 
 
 
460 aa  244  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.606567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1486  Phosphoglucomutase  32.62 
 
 
457 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000122855  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0369  phosphomannomutase  31.84 
 
 
501 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.391348  hitchhiker  0.00000119855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3749  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  32.84 
 
 
464 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0341  Phosphoglucomutase  32.54 
 
 
460 aa  238  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0442  Phosphoglucomutase  32.26 
 
 
460 aa  237  3e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0447  Phosphoglucomutase  32.97 
 
 
460 aa  236  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000142951  normal  0.775368 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0114  phosphomannomutase  33.47 
 
 
467 aa  234  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  hitchhiker  0.0000359682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0571  phosphoglucosamine mutase  31.11 
 
 
472 aa  232  9e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3078  Phosphoglucosamine mutase  32.98 
 
 
470 aa  230  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2655  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.8 
 
 
484 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1936  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  30.21 
 
 
463 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1955  Phosphoglucosamine mutase  32.32 
 
 
503 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.404155  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0410  phosphomannomutase  31.96 
 
 
460 aa  226  8e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.158132  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1140  Phosphomannomutase  31.19 
 
 
482 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.188407  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0352  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.38 
 
 
475 aa  223  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.345655 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03011  phosphotransferase superclass  31.88 
 
 
484 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0959823  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03021  phosphotransferase superclass  31.2 
 
 
484 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2223  Phosphoglucomutase  30.71 
 
 
490 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0282699 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0970  phosphoglucomutase  30.08 
 
 
479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0168511  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0280  phosphomannomutase  31.88 
 
 
484 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.91 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1768  Phosphomannomutase  29.91 
 
 
480 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03581  phosphotransferase superclass  29.38 
 
 
486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.37944  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03111  phosphotransferase superclass  31.06 
 
 
486 aa  210  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.309336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2367  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  28.6 
 
 
478 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000518249  normal  0.780869 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0038  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.46 
 
 
480 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1899  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  31.3 
 
 
473 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145231 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1644  phosphomannomutase  28.78 
 
 
486 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3839  Phosphoglucosamine mutase  30.77 
 
 
468 aa  202  8e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4933  Phosphoglucomutase  30.72 
 
 
477 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0612098 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0257  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.2 
 
 
487 aa  199  9e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0228  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  29.61 
 
 
487 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1292  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  27.99 
 
 
471 aa  195  2e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03051  phosphotransferase superclass  29.76 
 
 
485 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1268  phosphoglucomutase  27.56 
 
 
484 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.43258  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1893  phosphoglucomutase  30.29 
 
 
465 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.576391  normal  0.489627 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24991  phosphotransferase superclass  29.24 
 
 
487 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1269  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.19 
 
 
518 aa  178  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000278301  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  30.2 
 
 
548 aa  173  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  29.15 
 
 
450 aa  172  7.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  27.45 
 
 
559 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1417  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  29.19 
 
 
576 aa  170  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  28.66 
 
 
547 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  27.6 
 
 
480 aa  168  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  28.75 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  28.04 
 
 
548 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000458453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  29.67 
 
 
545 aa  166  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  28.63 
 
 
550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  28.29 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  29.1 
 
 
547 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0755  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.17 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0117608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  28.02 
 
 
548 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0958  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  28.79 
 
 
574 aa  163  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  28.63 
 
 
548 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1265  alpha-phosphoglucomutase  28.76 
 
 
578 aa  162  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>