More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002572 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  226  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  97.32 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  91.96 
 
 		 121 aa  211  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  83.04 
 
 		 112 aa  192  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  192  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  191  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  189  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  79.46 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  81.25 
 
 		 112 aa  188  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  188  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  79.46 
 
 		 112 aa  187  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  186  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 		 112 aa  186  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  184  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.21 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  73.21 
 
 		 112 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  77.68 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  77.68 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  77.68 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  77.68 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  75.89 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  77.68 
 
 		 112 aa  174  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  76.79 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  170  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  70.54 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  75 
 
 		 114 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 116 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 116 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03655  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.949365  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  74.11 
 
 		 112 aa  167  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  70.54 
 
 		 116 aa  167  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  167  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  166  7e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>