135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002445 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002445  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  190  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000631832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03592  hypothetical protein  97.78 
 
 		 90 aa  187  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0002  hypothetical protein  86.67 
 
 		 90 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000338126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0533  hypothetical protein  84.44 
 
 		 90 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000920147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02792  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.112634  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0733  Protein-tyrosine-phosphatase  82.76 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02755  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.115186  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4266  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3308  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0752  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.493276  normal  0.0113195 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3105  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252238 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3395  hypothetical protein  82.76 
 
 		 91 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1668  hypothetical protein  77.78 
 
 		 91 aa  157  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3027  Fe(II) trafficking protein YggX  80.68 
 
 		 90 aa  157  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3359  hypothetical protein  80.46 
 
 		 91 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0970298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3275  hypothetical protein  80.46 
 
 		 91 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3285  hypothetical protein  80.46 
 
 		 91 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.200191  normal  0.033805 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3454  hypothetical protein  80.46 
 
 		 91 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.811336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3351  hypothetical protein  80.46 
 
 		 91 aa  156  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.496198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3367  hypothetical protein  78.41 
 
 		 90 aa  155  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0165991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3207  Fe(II) trafficking protein YggX  79.55 
 
 		 90 aa  153  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261297  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3408  hypothetical protein  75.28 
 
 		 90 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.070297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0881  hypothetical protein  75.28 
 
 		 90 aa  148  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0818  hypothetical protein  75.56 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0152  hypothetical protein  75.56 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.957602  hitchhiker  0.0000034562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0819  hypothetical protein  75.56 
 
 		 90 aa  148  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4044  hypothetical protein  73.33 
 
 		 90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.846372  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2491  hypothetical protein  77.27 
 
 		 91 aa  143  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1107  hypothetical protein  74.44 
 
 		 92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2874  hypothetical protein  73.33 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429816  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0075  hypothetical protein  73.86 
 
 		 90 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.206235  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1318  hypothetical protein  77.01 
 
 		 92 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.959327  normal  0.498401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1218  hypothetical protein  73.33 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000284712  normal  0.540197 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2699  hypothetical protein  72.22 
 
 		 91 aa  140  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000360658  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1122  hypothetical protein  72.22 
 
 		 92 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000145882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4149  hypothetical protein  71.11 
 
 		 90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.786111  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3369  hypothetical protein  70 
 
 		 92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1179  hypothetical protein  71.26 
 
 		 92 aa  136  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1250  hypothetical protein  71.26 
 
 		 92 aa  136  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00387926  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1180  hypothetical protein  71.26 
 
 		 92 aa  136  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000191738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1324  hypothetical protein  68.89 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000513126  normal  0.0116062 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3040  hypothetical protein  68.89 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000474974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2701  hypothetical protein  68.89 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665477  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3054  hypothetical protein  68.89 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00037558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3197  hypothetical protein  68.89 
 
 		 92 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000564871  normal  0.56493 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0375  hypothetical protein  70.11 
 
 		 89 aa  133  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.374308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00283  hypothetical protein  68.18 
 
 		 90 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1372  hypothetical protein  55.06 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0478  hypothetical protein  61.04 
 
 		 77 aa  107  5e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.252917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1544  hypothetical protein  57.47 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251513  normal  0.581544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1924  hypothetical protein  52.81 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.441849  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1798  hypothetical protein  52.81 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.716542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2102  hypothetical protein  52.81 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.183711  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2944  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.807996  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0024  hypothetical protein  52.22 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.828588  normal  0.104747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0133  hypothetical protein  50.55 
 
 		 109 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1511  hypothetical protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4260  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221746  hitchhiker  0.00000000242965 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1524  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.384209  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2624  hypothetical protein  56.67 
 
 		 91 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.804415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3583  hypothetical protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.507536 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2268  hypothetical protein  51.11 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1850  Fe(II) trafficking protein YggX  55.68 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.302914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1114  hypothetical protein  53.85 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158096  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1490  hypothetical protein  54.95 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0380307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1222  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2229  hypothetical protein  53.33 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2982  hypothetical protein  54.44 
 
 		 90 aa  100  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3047  hypothetical protein  55.06 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.45877  normal  0.0178408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1263  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.339369  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0687  hypothetical protein  52.27 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.166712  normal  0.641044 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5466  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5920  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2157  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2175  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2485  Fe(II) trafficking protein YggX  52.22 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0570791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1836  hypothetical protein  50.55 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703285  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1752  hypothetical protein  49.45 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2778  hypothetical protein  49.45 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2261  hypothetical protein  49.45 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283774  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3058  hypothetical protein  49.45 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2644  hypothetical protein  49.45 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2700  hypothetical protein  49.45 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0938348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1533  hypothetical protein  49.45 
 
 		 91 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.795875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2067  hypothetical protein  48.89 
 
 		 91 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1142  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2344  hypothetical protein  47.19 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2194  hypothetical protein  47.78 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.609831  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1132  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4642  hypothetical protein  50.56 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451223  hitchhiker  0.0000118597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4923  hypothetical protein  52.75 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000436986 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0285  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5343  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4902  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2071  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.152399  normal  0.926717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2423  hypothetical protein  46.07 
 
 		 93 aa  95.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0305  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284678 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1002  hypothetical protein  46.67 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0880728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0310  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68000  hypothetical protein  49.44 
 
 		 90 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0291982  normal  0.0102639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>