More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002410 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002410  uncharacterized ABC transporter permease component YrbE  100 
 
 		 263 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03657  hypothetical protein  93.54 
 
 		 263 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2101  hypothetical protein  87.21 
 
 		 258 aa  457  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0506  toluene tolerance protein Ttg2B  80.08 
 
 		 264 aa  425  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.156357  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  78.76 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0289  protein of unknown function DUF140  78.38 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.16381  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0513  hypothetical protein  76.86 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1145  hypothetical protein  76.86 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0449  putative ABC transporter, permease protein YrbE  76.86 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.487258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  76.45 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4359  hypothetical protein  74.9 
 
 		 260 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.775319  normal  0.0567326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3807  protein of unknown function DUF140  77.25 
 
 		 260 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  74.32 
 
 		 259 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1172  ABC transporter permease  75.1 
 
 		 261 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3630  hypothetical protein  72.97 
 
 		 260 aa  374  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.485791  normal  0.147017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03059  predicted toluene transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0940614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0513  protein of unknown function DUF140  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0661254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3682  toluene ABC transporter, permease protein  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00933365  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4516  toluene ABC transporter, permease protein  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  0.870987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3387  toluene ABC transporter, permease protein  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03010  hypothetical protein  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0755096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  72.76 
 
 		 258 aa  371  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3490  toluene ABC transporter, permease protein  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0506  hypothetical protein  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.182378 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3576  toluene ABC transporter, permease protein  72.59 
 
 		 260 aa  370  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.884023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3080  hypothetical protein  72.44 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3504  toluene ABC transporter permease  71.43 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3609  toluene ABC transporter permease  71.43 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.37006 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3671  toluene ABC transporter permease  71.04 
 
 		 260 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0326446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3573  toluene ABC transporter permease protein  71.43 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3502  toluene ABC transporter, permease protein  71.43 
 
 		 260 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0158208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3661  hypothetical protein  70.2 
 
 		 261 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0857577  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3953  hypothetical protein  69.2 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0723  hypothetical protein  70.2 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0693  hypothetical protein  70.2 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0722  hypothetical protein  69.23 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0714  protein of unknown function DUF140  70.2 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0679  hypothetical protein  70.59 
 
 		 261 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.876279  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4232  hypothetical protein  68.85 
 
 		 260 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0680  hypothetical protein  70.2 
 
 		 261 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3342  hypothetical protein  70.2 
 
 		 261 aa  354  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.279252 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  68.46 
 
 		 260 aa  352  4e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3303  hypothetical protein  69.41 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3608  hypothetical protein  66.54 
 
 		 261 aa  348  6e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  67.05 
 
 		 260 aa  345  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  69.92 
 
 		 258 aa  343  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  68.53 
 
 		 265 aa  342  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  65.27 
 
 		 265 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  68.92 
 
 		 265 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  68.92 
 
 		 265 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  64.73 
 
 		 261 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  65.9 
 
 		 265 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  65.52 
 
 		 265 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12860  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, permease component  67.45 
 
 		 265 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  65.5 
 
 		 260 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  63.6 
 
 		 265 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  63.6 
 
 		 265 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  63.6 
 
 		 266 aa  327  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  64.94 
 
 		 265 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  65.38 
 
 		 265 aa  319  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  60 
 
 		 261 aa  310  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  64.94 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  62.85 
 
 		 262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  61.9 
 
 		 263 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0385  protein of unknown function DUF140  61.57 
 
 		 260 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2748  hypothetical protein  61.26 
 
 		 265 aa  301  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2222  hypothetical protein  62.95 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.12831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  64.1 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  61.02 
 
 		 258 aa  296  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  59.22 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  59.22 
 
 		 260 aa  294  1e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  59.84 
 
 		 258 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2412  hypothetical protein  62.55 
 
 		 260 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.819451  normal  0.102751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  59.76 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  60.8 
 
 		 262 aa  285  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  60.47 
 
 		 260 aa  284  9e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  60.8 
 
 		 265 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  60.24 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  59.38 
 
 		 264 aa  281  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  65.92 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  65.92 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  59.29 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  65.92 
 
 		 255 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  65.47 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  65.47 
 
 		 255 aa  278  6e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  59.68 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  59.29 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  65.02 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  57.03 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  65.02 
 
 		 255 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  57.94 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  59.84 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  57.54 
 
 		 260 aa  271  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0889  protein of unknown function DUF140  56.15 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  63.84 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3401  hypothetical protein  53.91 
 
 		 263 aa  268  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  63.3 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  63.3 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  55.25 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  55.25 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>