More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002392 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  40.57 
 
 		 960 aa  657    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  63.26 
 
 		 968 aa  1310    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  63.26 
 
 		 968 aa  1310    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  62.33 
 
 		 967 aa  1276    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  49.84 
 
 		 948 aa  910    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  59.86 
 
 		 968 aa  1241    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  46.49 
 
 		 949 aa  829    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  58.95 
 
 		 968 aa  1223    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  59.96 
 
 		 968 aa  1244    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  50 
 
 		 948 aa  909    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  48.98 
 
 		 975 aa  983    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  59.86 
 
 		 968 aa  1231    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  63.26 
 
 		 968 aa  1310    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  49.9 
 
 		 948 aa  910    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  43.45 
 
 		 958 aa  835    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  43.25 
 
 		 958 aa  830    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  63.16 
 
 		 968 aa  1307    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  45.11 
 
 		 953 aa  815    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  49.69 
 
 		 948 aa  912    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  41.39 
 
 		 982 aa  709    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  95.46 
 
 		 969 aa  1895    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  49.64 
 
 		 948 aa  911    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  59.86 
 
 		 968 aa  1241    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  39.39 
 
 		 982 aa  681    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  62.33 
 
 		 967 aa  1275    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  49.95 
 
 		 948 aa  915    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  63.26 
 
 		 967 aa  1286    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  59.34 
 
 		 968 aa  1234    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  61.61 
 
 		 967 aa  1263    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  49.59 
 
 		 948 aa  909    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  63.16 
 
 		 968 aa  1308    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  85.86 
 
 		 969 aa  1755    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  45.94 
 
 		 947 aa  874    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  63.26 
 
 		 968 aa  1310    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  62.22 
 
 		 944 aa  1263    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  79.77 
 
 		 969 aa  1649    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  62.75 
 
 		 968 aa  1305    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  62.85 
 
 		 968 aa  1307    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  58.13 
 
 		 968 aa  1205    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  59.86 
 
 		 968 aa  1239    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  42.22 
 
 		 980 aa  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  41.37 
 
 		 1028 aa  703    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  62.85 
 
 		 968 aa  1307    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  48.29 
 
 		 943 aa  920    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  54.79 
 
 		 966 aa  1060    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  48.91 
 
 		 949 aa  900    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  60.06 
 
 		 968 aa  1241    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  60.06 
 
 		 968 aa  1239    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  62.64 
 
 		 968 aa  1297    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  58.02 
 
 		 968 aa  1209    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  49.59 
 
 		 950 aa  910    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  57.59 
 
 		 968 aa  1198    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  63.16 
 
 		 968 aa  1307    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  60.06 
 
 		 968 aa  1238    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  62.85 
 
 		 968 aa  1307    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  63.26 
 
 		 968 aa  1310    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  63.26 
 
 		 968 aa  1310    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  63.36 
 
 		 968 aa  1309    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  58.85 
 
 		 968 aa  1220    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  62.54 
 
 		 968 aa  1296    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  49.59 
 
 		 948 aa  902    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  62.5 
 
 		 919 aa  1229    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  59.79 
 
 		 967 aa  1217    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  62.64 
 
 		 968 aa  1297    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  57.25 
 
 		 970 aa  1174    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  57.69 
 
 		 968 aa  1197    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  48.86 
 
 		 947 aa  894    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  100 
 
 		 969 aa  1998    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  37.36 
 
 		 942 aa  612  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  36.03 
 
 		 874 aa  557  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 		 905 aa  206  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 		 941 aa  171  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.96 
 
 		 941 aa  171  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.66 
 
 		 933 aa  161  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  28.2 
 
 		 560 aa  159  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  28.6 
 
 		 560 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  27.72 
 
 		 560 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  27.72 
 
 		 560 aa  157  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  27.72 
 
 		 560 aa  157  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  27.72 
 
 		 560 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  27.72 
 
 		 560 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  27.72 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  27.72 
 
 		 560 aa  156  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  27.54 
 
 		 560 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  27.75 
 
 		 560 aa  153  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  27.64 
 
 		 584 aa  149  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  29.22 
 
 		 584 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  27.87 
 
 		 669 aa  143  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  24.49 
 
 		 969 aa  141  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  28.63 
 
 		 555 aa  140  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  30.73 
 
 		 898 aa  138  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.65 
 
 		 1138 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  30.47 
 
 		 892 aa  137  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  30.57 
 
 		 898 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  27.57 
 
 		 1167 aa  134  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.54 
 
 		 1167 aa  134  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  26.01 
 
 		 554 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  27.82 
 
 		 1201 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  27.82 
 
 		 1201 aa  129  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  25.87 
 
 		 945 aa  128  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>