More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002368 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002368  MSHA biogenesis protein MshL  100 
 
 		 530 aa  1065    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2820  MSHA biogenesis protein MshL  68.01 
 
 		 559 aa  711    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0469  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHD)  65.73 
 
 		 546 aa  707    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00341212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03698  hypothetical protein  90.19 
 
 		 544 aa  937    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3768  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  48.88 
 
 		 556 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4417  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  48.88 
 
 		 562 aa  505  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3347  type II and III secretion system protein  50.37 
 
 		 549 aa  504  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3751  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  48.97 
 
 		 556 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0544  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  48.6 
 
 		 567 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3663  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  51.53 
 
 		 561 aa  497  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3486  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  51.53 
 
 		 561 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.552648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0466  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  51.53 
 
 		 561 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.142109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0454  MSHA biogenesis protein MshL  49.81 
 
 		 561 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4112  MSHA biogenesis protein MshL  51.43 
 
 		 560 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0508  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  49.81 
 
 		 559 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0484  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  49.81 
 
 		 559 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0505  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  51.53 
 
 		 559 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3835  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  49.81 
 
 		 559 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0560  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  48.05 
 
 		 558 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0389  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  46.77 
 
 		 563 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0170  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  49.11 
 
 		 550 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4576  MSHA biogenesis protein MshL  43.39 
 
 		 609 aa  433  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00251  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshL (pilus type IV)  42.52 
 
 		 569 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0385  type II and III secretion system protein  41.52 
 
 		 537 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.16862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0753  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  40.15 
 
 		 572 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22971  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1135  MSHA biogenesis protein MshL  42.22 
 
 		 543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00664047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3332  type II and III secretion system protein  37.57 
 
 		 614 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.449777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3096  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  38.7 
 
 		 577 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0329  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  36.7 
 
 		 538 aa  326  8.000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.683129  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0764  general secretion pathway protein D  37.66 
 
 		 554 aa  324  3e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000564128  normal  0.152478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0893  type II and III secretion system secretin  39.38 
 
 		 585 aa  316  7e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3405  type II and III secretion system protein  28.11 
 
 		 594 aa  163  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0887  type II and III secretion system protein  26.74 
 
 		 625 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0606978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0109  type II and III secretion system protein  28.25 
 
 		 547 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.379094  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3259  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  25.78 
 
 		 830 aa  156  8e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701174 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1384  type II and III secretion system protein  27.23 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.157655  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1007  type II and III secretion system protein  26.22 
 
 		 512 aa  151  3e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0076  type II and III secretion system protein  26.42 
 
 		 539 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1968  type II and III secretion system protein  25 
 
 		 506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1343  Type II secretory pathway component PulD-like  30.61 
 
 		 546 aa  144  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.255385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1056  type II and III secretion system protein  25.27 
 
 		 541 aa  141  3e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0036675  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1647  general secretory pathway protein D  25.58 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.948115  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1467  general secretory pathway protein D  25.58 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0639  type II and III secretion system protein  25.73 
 
 		 569 aa  139  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1227  PP family ATPase  26.95 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1821  general secretory pathway protein D  24.88 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.533467  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0549  putative Type II secretory pathway component PulD  27.22 
 
 		 581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1036  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  23.98 
 
 		 506 aa  130  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0928  pilus (MSHA type) biogenesis protein MshL  27.52 
 
 		 574 aa  124  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0351042  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0390  putative type II protein secretion system D protein CtsD  23.64 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  30.42 
 
 		 675 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  30.32 
 
 		 641 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  25.15 
 
 		 710 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18620  type II and III secretion system protein  34.45 
 
 		 602 aa  107  6e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  31.09 
 
 		 705 aa  107  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  25.27 
 
 		 580 aa  107  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  31.07 
 
 		 686 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0500  type II secretion system protein, putative  24.84 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.555962  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  28.8 
 
 		 810 aa  104  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  25.43 
 
 		 726 aa  104  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  29.03 
 
 		 716 aa  103  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  28.22 
 
 		 672 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  26.95 
 
 		 751 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  29.33 
 
 		 763 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28.19 
 
 		 635 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  27.46 
 
 		 696 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  26.03 
 
 		 697 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  29.33 
 
 		 703 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  29.84 
 
 		 662 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  28.57 
 
 		 660 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  29.81 
 
 		 681 aa  101  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  27.24 
 
 		 656 aa  100  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  29.39 
 
 		 787 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  30.84 
 
 		 700 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  30.84 
 
 		 700 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  28 
 
 		 750 aa  100  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  29.19 
 
 		 630 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  28.72 
 
 		 781 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  30.23 
 
 		 714 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  29.69 
 
 		 704 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  29.5 
 
 		 706 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  27.45 
 
 		 640 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  27.27 
 
 		 658 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  30.32 
 
 		 703 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  28.37 
 
 		 640 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  30.4 
 
 		 740 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  28.29 
 
 		 640 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  28.37 
 
 		 640 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  28.97 
 
 		 705 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  28.94 
 
 		 724 aa  98.2  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  28.37 
 
 		 640 aa  98.6  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  28.08 
 
 		 789 aa  97.8  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  30.32 
 
 		 702 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  32.96 
 
 		 706 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  28.66 
 
 		 705 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  29.67 
 
 		 703 aa  98.2  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  28.73 
 
 		 797 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  30 
 
 		 704 aa  97.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  23.58 
 
 		 716 aa  97.8  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  28.9 
 
 		 819 aa  97.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>