More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002328 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00027  3-dehydroquinate synthase  92.62 
 
 		 366 aa  704    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002328  3-dehydroquinate synthase  100 
 
 		 366 aa  751    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000221553  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2205  3-dehydroquinate synthase  76.5 
 
 		 366 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000150156  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2723  3-dehydroquinate synthase  72.85 
 
 		 362 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3367  3-dehydroquinate synthase  65.83 
 
 		 359 aa  488  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0475831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4604  3-dehydroquinate synthase  64.72 
 
 		 366 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000760296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3697  3-dehydroquinate synthase  63.23 
 
 		 359 aa  474  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0194599  normal  0.984962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0248  3-dehydroquinate synthase  63.51 
 
 		 359 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000249526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3705  3-dehydroquinate synthase  63.33 
 
 		 359 aa  472  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000820021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4083  3-dehydroquinate synthase  63.33 
 
 		 358 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000010907  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3893  3-dehydroquinate synthase  63.23 
 
 		 359 aa  471  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000115633  normal  0.386529 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4112  3-dehydroquinate synthase  63.06 
 
 		 358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000335612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0287  3-dehydroquinate synthase  62.67 
 
 		 359 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0239  3-dehydroquinate synthase  62.95 
 
 		 359 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000355339  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4002  3-dehydroquinate synthase  63.06 
 
 		 358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000746069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4201  3-dehydroquinate synthase  63.06 
 
 		 358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000411195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3683  3-dehydroquinate synthase  63.33 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0345563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0376  3-dehydroquinate synthase  61.43 
 
 		 358 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00801427  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3685  3-dehydroquinate synthase  63.06 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000289356  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0214  3-dehydroquinate synthase  62.78 
 
 		 358 aa  462  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019522  hitchhiker  0.0093174 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3854  3-dehydroquinate synthase  63.06 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3792  3-dehydroquinate synthase  63.06 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0348959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3758  3-dehydroquinate synthase  63.06 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0998523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0339  3-dehydroquinate synthase  61.11 
 
 		 361 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0341  3-dehydroquinate synthase  61.11 
 
 		 358 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3802  3-dehydroquinate synthase  62.78 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0821426  normal  0.876951 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4264  3-dehydroquinate synthase  59.44 
 
 		 358 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00482631  normal  0.106006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03241  3-dehydroquinate synthase  61.39 
 
 		 362 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00972152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0324  3-dehydroquinate synthase  61.39 
 
 		 362 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3882  3-dehydroquinate synthase  62.22 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0261483  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3859  3-dehydroquinate synthase  61.39 
 
 		 362 aa  441  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000380736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4059  3-dehydroquinate synthase  62.5 
 
 		 361 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000961699  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03193  hypothetical protein  61.39 
 
 		 362 aa  441  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00984736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0164  3-dehydroquinate synthase  58.42 
 
 		 356 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.300731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3766  3-dehydroquinate synthase  60.83 
 
 		 362 aa  438  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4693  3-dehydroquinate synthase  61.39 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0226  3-dehydroquinate synthase  62.05 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000635548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0324  3-dehydroquinate synthase  61.39 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000222856  normal  0.122437 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3965  3-dehydroquinate synthase  62.05 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154886  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3585  3-dehydroquinate synthase  61.39 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000415284  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3665  3-dehydroquinate synthase  61.39 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000293166  normal  0.0474633 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3726  3-dehydroquinate synthase  62.05 
 
 		 362 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000354309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0262  3-dehydroquinate synthase  57.89 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00142699  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00509  3-dehydroquinate synthase  61.17 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0026349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0261  3-dehydroquinate synthase  59.72 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0548  3-dehydroquinate synthase  58.43 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0665  3-dehydroquinate synthase  56.2 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000291417  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3030  3-dehydroquinate synthase  58.29 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2685  3-dehydroquinate synthase  57.97 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0391774 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0473  3-dehydroquinate synthase  54.47 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068114  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5126  3-dehydroquinate synthase  55.56 
 
 		 367 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1114  3-dehydroquinate synthase  56.86 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0407056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5775  3-dehydroquinate synthase  57.02 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2455  3-dehydroquinate synthase  56.39 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0307726  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66600  3-dehydroquinate synthase  56.74 
 
 		 368 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5078  3-dehydroquinate synthase  55.4 
 
 		 365 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0411  3-dehydroquinate synthase  56.39 
 
 		 366 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0359503  normal  0.217295 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2279  3-dehydroquinate synthase  55.74 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5128  3-dehydroquinate synthase  55.12 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0315  3-dehydroquinate synthase  55.06 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0328402 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0268  3-dehydroquinate synthase  56.32 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.230389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4951  3-dehydroquinate synthase  55.12 
 
 		 365 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2136  3-dehydroquinate synthase  55.56 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.122395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0388  3-dehydroquinate synthase  54.57 
 
 		 365 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0832  3-dehydroquinate synthase  55.59 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.162832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0409  3-dehydroquinate synthase  54.72 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0023  3-dehydroquinate synthase  54.18 
 
 		 359 aa  385  1e-106  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4116  3-dehydroquinate synthase  54.86 
 
 		 368 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0253  3-dehydroquinate synthase  55.68 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0331  3-dehydroquinate synthase  53.7 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0703  3-dehydroquinate synthase  52.47 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45240  3-dehydroquinate synthase  56.51 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0216  3-dehydroquinate synthase  55.83 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.411301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38791  predicted protein  51.93 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0409062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3129  3-dehydroquinate synthase  50.41 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5574  3-dehydroquinate synthase  54.49 
 
 		 372 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.751857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1146  3-dehydroquinate synthase  54.05 
 
 		 370 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3597  3-dehydroquinate synthase  54.44 
 
 		 361 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00180341  hitchhiker  0.0000000386379 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1877  3-dehydroquinate synthase  51.25 
 
 		 388 aa  360  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.384735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3266  3-dehydroquinate synthase  50.14 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.966202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20809  3-dehydroquinate synthase  51.26 
 
 		 431 aa  360  2e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3247  3-dehydroquinate synthase  51.59 
 
 		 368 aa  360  3e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2900  3-dehydroquinate synthase  50.42 
 
 		 368 aa  359  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.146748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2319  3-dehydroquinate synthase  51.25 
 
 		 369 aa  358  7e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245464  normal  0.624104 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2098  3-dehydroquinate synthase  51.13 
 
 		 360 aa  358  9e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0614  3-dehydroquinate synthase  53.87 
 
 		 370 aa  358  9e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0360  3-dehydroquinate synthase  54.55 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173183  normal  0.0544969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0321  3-dehydroquinate synthase  52.66 
 
 		 359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2793  3-dehydroquinate synthase  51.54 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3107  3-dehydroquinate synthase  50.83 
 
 		 370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0679  3-dehydroquinate synthase  51.51 
 
 		 372 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0312  3-dehydroquinate synthase  52.66 
 
 		 359 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.567961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2969  3-dehydroquinate synthase  50.43 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.351532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3400  3-dehydroquinate synthase  52.35 
 
 		 373 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0125  3-dehydroquinate synthase  51.13 
 
 		 359 aa  354  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.225927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3490  3-dehydroquinate synthase  51.78 
 
 		 359 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0881  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.100912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0733  3-dehydroquinate synthase  50 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3728  3-dehydroquinate synthase  52.37 
 
 		 359 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3023  3-dehydroquinate synthase  52.54 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>