More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002257 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 670 aa  1373    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  84.58 
 
 		 681 aa  1170    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  65.59 
 
 		 653 aa  811    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  53.76 
 
 		 652 aa  691    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  50.15 
 
 		 615 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  50.15 
 
 		 615 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  50 
 
 		 615 aa  605  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  49.85 
 
 		 615 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  50 
 
 		 615 aa  602  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  50 
 
 		 615 aa  602  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  49.55 
 
 		 615 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  49.7 
 
 		 615 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  49.04 
 
 		 613 aa  595  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  49.04 
 
 		 624 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  48.66 
 
 		 669 aa  588  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  48.56 
 
 		 661 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  48.14 
 
 		 618 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  48.4 
 
 		 635 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  48.29 
 
 		 618 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  48.29 
 
 		 618 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  48.4 
 
 		 635 aa  579  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  48.14 
 
 		 618 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  47.48 
 
 		 649 aa  580  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  47.99 
 
 		 618 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  47.62 
 
 		 628 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  71.69 
 
 		 635 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  44.97 
 
 		 615 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  70.48 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  46.68 
 
 		 628 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  46.86 
 
 		 614 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  45.91 
 
 		 665 aa  489  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  44.49 
 
 		 644 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  45.65 
 
 		 644 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  43.66 
 
 		 637 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  44.84 
 
 		 641 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  43.81 
 
 		 638 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0795  DNA mismatch repair protein  47.66 
 
 		 624 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.741444  hitchhiker  0.00456525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  44.61 
 
 		 648 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0564  DNA mismatch repair protein  45.03 
 
 		 631 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.273606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  43.66 
 
 		 638 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0323  DNA mismatch repair protein MutL  45.36 
 
 		 652 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0601  DNA mismatch repair protein  44.38 
 
 		 631 aa  482  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3976  DNA mismatch repair protein MutL  44.01 
 
 		 639 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  45.18 
 
 		 619 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  45.44 
 
 		 650 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  43.35 
 
 		 630 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  45.42 
 
 		 629 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  44.1 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  43.05 
 
 		 632 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  43.31 
 
 		 633 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  43 
 
 		 632 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  42.88 
 
 		 633 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  42.62 
 
 		 630 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  43.17 
 
 		 648 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  44.21 
 
 		 635 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  42.69 
 
 		 641 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  42.45 
 
 		 645 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  62.92 
 
 		 633 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  62.61 
 
 		 633 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  42.14 
 
 		 641 aa  435  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  58.89 
 
 		 608 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0584  DNA mismatch repair protein MutL  57.4 
 
 		 602 aa  405  1e-111  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.969564  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  57.75 
 
 		 644 aa  398  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  39.87 
 
 		 625 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  58.15 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  55.32 
 
 		 636 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  55.76 
 
 		 611 aa  385  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  54.78 
 
 		 634 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  55.35 
 
 		 620 aa  365  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  53.17 
 
 		 630 aa  359  8e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  53.92 
 
 		 621 aa  355  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  53.92 
 
 		 619 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  54.24 
 
 		 583 aa  352  8.999999999999999e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  37.23 
 
 		 626 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  36.54 
 
 		 652 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  37.6 
 
 		 636 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  52.71 
 
 		 575 aa  334  3e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  50 
 
 		 574 aa  334  4e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  35.96 
 
 		 691 aa  332  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  36.07 
 
 		 661 aa  332  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  51.67 
 
 		 613 aa  332  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  38.18 
 
 		 628 aa  332  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  51.96 
 
 		 647 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  51.96 
 
 		 635 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.09 
 
 		 628 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  49.12 
 
 		 617 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  50.45 
 
 		 655 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  36.42 
 
 		 705 aa  326  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  50 
 
 		 667 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  50 
 
 		 667 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  50 
 
 		 667 aa  324  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  51.22 
 
 		 598 aa  324  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  52.13 
 
 		 616 aa  323  6e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2752  DNA mismatch repair protein MutL  45.86 
 
 		 576 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  49.7 
 
 		 662 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  49.4 
 
 		 661 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  35.6 
 
 		 687 aa  320  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 647 aa  320  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  49.1 
 
 		 661 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  50.46 
 
 		 615 aa  317  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>