More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002237 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  73.54 
 
 		 602 aa  884    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04026  fumarate reductase  73.54 
 
 		 602 aa  884    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  73.54 
 
 		 602 aa  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4625  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.54 
 
 		 602 aa  885    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0290793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.37 
 
 		 602 aa  882    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  95.7 
 
 		 606 aa  1166    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.43 
 
 		 617 aa  1073    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4704  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.68 
 
 		 596 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.698636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4621  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.68 
 
 		 596 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3813  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.58 
 
 		 607 aa  909    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.924769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0714  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.58 
 
 		 607 aa  909    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.46 
 
 		 598 aa  929    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4761  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.68 
 
 		 596 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.838458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4398  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.37 
 
 		 602 aa  882    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0419  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.46 
 
 		 598 aa  923    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000541529 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4740  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.51 
 
 		 596 aa  887    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.46 
 
 		 598 aa  930    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1725  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.91 
 
 		 594 aa  733    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.29 
 
 		 598 aa  923    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1277  fumarate reductase flavoprotein subunit  71.87 
 
 		 599 aa  868    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.572421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  94.15 
 
 		 602 aa  1146    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.54 
 
 		 602 aa  884    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0354  fumarate reductase flavoprotein subunit  80.58 
 
 		 591 aa  983    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1450  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.99 
 
 		 590 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 599 aa  1245    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4613  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.85 
 
 		 596 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  72.8 
 
 		 596 aa  890    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.54 
 
 		 602 aa  884    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3667  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.58 
 
 		 607 aa  909    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  67.29 
 
 		 603 aa  856    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4686  fumarate reductase flavoprotein subunit  73.54 
 
 		 602 aa  883    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.322244  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  74.96 
 
 		 598 aa  929    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11584  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.36 
 
 		 583 aa  598  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.532611 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0166  Succinate dehydrogenase  45.79 
 
 		 711 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  47.52 
 
 		 568 aa  489  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.4 
 
 		 575 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.83 
 
 		 598 aa  465  1e-129  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.98 
 
 		 575 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.98 
 
 		 575 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.36 
 
 		 592 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  43.65 
 
 		 577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.4 
 
 		 591 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.36 
 
 		 592 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.19 
 
 		 592 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  41.65 
 
 		 592 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.19 
 
 		 592 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.03 
 
 		 592 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.19 
 
 		 592 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.05 
 
 		 583 aa  442  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.78 
 
 		 579 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.5 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  40.17 
 
 		 596 aa  439  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.9 
 
 		 591 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.71 
 
 		 587 aa  437  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.69 
 
 		 567 aa  437  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.09 
 
 		 602 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.93 
 
 		 598 aa  436  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  41.95 
 
 		 570 aa  438  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.07 
 
 		 567 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  43.27 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.47 
 
 		 575 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.89 
 
 		 581 aa  438  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  41.44 
 
 		 573 aa  435  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.63 
 
 		 592 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.29 
 
 		 612 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.95 
 
 		 595 aa  435  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.66 
 
 		 595 aa  434  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.83 
 
 		 584 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.21 
 
 		 567 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  42.78 
 
 		 598 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.56 
 
 		 595 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.9 
 
 		 591 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.43 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  40.2 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.29 
 
 		 582 aa  431  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.9 
 
 		 591 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  42.13 
 
 		 567 aa  430  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  40.5 
 
 		 592 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41 
 
 		 592 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.45 
 
 		 567 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  40.47 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.64 
 
 		 581 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  41.93 
 
 		 583 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.9 
 
 		 591 aa  424  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.4 
 
 		 595 aa  424  1e-117  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  40.99 
 
 		 597 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.73 
 
 		 591 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  40.36 
 
 		 601 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.46 
 
 		 590 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.34 
 
 		 584 aa  422  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  39.8 
 
 		 601 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>