76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002220 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002220  P pilus assembly/Cpx signaling pathway, periplasmic inhibitor/zinc- resistance associated protein  100 
 
 
170 aa  350  7e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000285493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  70.66 
 
 
169 aa  238  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  54.43 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  48.08 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  43.45 
 
 
168 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0282  protein of unknown function Spy-related  35.21 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000126692  unclonable  0.0000000242912 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  33.54 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3431  spheroplast protein y precursor, putative  36.6 
 
 
163 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000129305  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1448  periplasmic protein  31.54 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.351784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0280  protein of unknown function, Spy-related  34.48 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000525037  unclonable  0.0000000000829203 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.71 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.71 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  31.71 
 
 
162 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1987  periplasmic protein  33.91 
 
 
156 aa  60.8  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1701  periplasmic protein  32.68 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1376  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  36.89 
 
 
185 aa  60.1  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2461  periplasmic protein  33.91 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.771279 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1889  periplasmic protein  33.91 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0214955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1964  periplasmic protein  33.91 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0254  protein of unknown function, Spy-related  39.05 
 
 
163 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000550011  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01712  envelope stress induced periplasmic protein  33.04 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01700  hypothetical protein  33.04 
 
 
161 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  34.48 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0253  protein of unknown function, Spy-related  37.19 
 
 
163 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000205349  hitchhiker  0.000372635 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1899  protein of unknown function Spy-related protein  33.04 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0539  periplasmic protein  30.72 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1825  periplasmic protein  33.04 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3377  protein of unknown function Spy-related  33.11 
 
 
157 aa  57.4  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1436  periplasmic protein  33.03 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1421  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2037  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195484  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1864  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.978086  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1404  periplasmic protein  33.33 
 
 
161 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.181136 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3569  protein of unknown function, Spy-related  30.97 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000221664  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2662  hypothetical protein  29.55 
 
 
162 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.117533  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0255  protein of unknown function Spy-related  30.26 
 
 
174 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000430973  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3932  protein of unknown function Spy-related  32.41 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000105476  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0563  hypothetical protein  30.12 
 
 
163 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439139  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1222  protein of unknown function, Spy-related  29.75 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0499596  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4741  periplasmic protein  29.67 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0313  spheroplast protein y precursor, putative  31.06 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000163608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0262  protein of unknown function Spy-related  34.62 
 
 
174 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00734825  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0756  periplasmic protein  31.86 
 
 
162 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.276898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0262  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000518811  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0257  protein of unknown function Spy-related  33.33 
 
 
174 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000663543  decreased coverage  0.0000115808 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3144  hypothetical protein  29.75 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4459  protein of unknown function, Spy-related  29.61 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4476  spheroplast protein y precursor, putative  33.33 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1143  hypothetical protein  30.43 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4144  periplasmic repressor CpxP  27.56 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4104  periplasmic repressor CpxP  27.56 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.477556  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4071  protein of unknown function Spy-related protein  27.56 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4306  periplasmic repressor CpxP  27.56 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.24903  normal  0.013655 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4447  periplasmic repressor CpxP  27.56 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5368  periplasmic repressor CpxP  27.56 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03748  hypothetical protein  25.81 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.493824  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3849  putative stress resistance protein  25.57 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227147  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03799  periplasmic protein combats stress  25.81 
 
 
166 aa  44.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.37018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4809  periplasmic repressor of cpx regulon by interaction with CpxA, rescue from transitory stresses  27.85 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000567342 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  25 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  27.22 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4393  periplasmic repressor CpxP  25.32 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  25.48 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3460  spheroplast protein y precursor, putative  31.09 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000066442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  30.21 
 
 
166 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  36.67 
 
 
166 aa  42  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0129  putative stress resistance protein  32.97 
 
 
174 aa  42  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.291155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  30.21 
 
 
166 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  27.1 
 
 
166 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.5664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  30.21 
 
 
166 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  30.21 
 
 
166 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3847  hypothetical protein  24.79 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1674  hypothetical protein  26.35 
 
 
136 aa  41.6  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  27.52 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0892  envelope stress induced periplasmic protein, Spy-related  30.28 
 
 
210 aa  40.8  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0456939  normal  0.690195 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2300  protein of unknown function, Spy-related  28.48 
 
 
147 aa  40.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000000365275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>