More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002219 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002219  copper-sensing two-component system response regulator CpxR  100 
 
 		 229 aa  463  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000572967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00149  transcriptional regulator CpxR  93.01 
 
 		 229 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2264  transcriptional regulator CpxR  79.91 
 
 		 228 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000005667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1562  two component transcriptional regulator  75.55 
 
 		 228 aa  350  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000591425  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2797  transcriptional regulator, CpxR  71.18 
 
 		 227 aa  311  4.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000288823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0311  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  59.03 
 
 		 228 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00012342  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0136  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  61.57 
 
 		 232 aa  276  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0128  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  61.14 
 
 		 232 aa  275  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3570  two component transcriptional regulator  60.35 
 
 		 227 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000660562  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03798  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with CpxA  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4072  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.476785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5367  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4033  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  60.7 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4446  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03747  hypothetical protein  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0830559  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4392  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4105  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.393063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0517203  normal  0.0145886 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4143  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  63.32 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4060  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  62.45 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3850  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  61.14 
 
 		 232 aa  261  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.308855  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4346  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  62.45 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.591439  hitchhiker  0.0000000817459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4390  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  62.45 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4276  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  62.45 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4457  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  62.45 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4305  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  62.45 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3432  response regulator receiver protein  58.77 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000345172  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0281  two component transcriptional regulator  61.23 
 
 		 227 aa  259  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000215794  unclonable  0.0000000255624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0279  two component transcriptional regulator  58.59 
 
 		 227 aa  258  7e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000622263  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4132  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  60.61 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000494358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0081  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  60.61 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0084  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  60.61 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.601085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4810  DNA-binding transcriptional regulator CpxR  60.7 
 
 		 232 aa  254  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3933  two component transcriptional regulator  56.39 
 
 		 227 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3461  response regulator receiver  55.07 
 
 		 226 aa  240  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0261  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 228 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000347248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0254  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000326652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0256  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.71 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000272342  decreased coverage  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4477  transcriptional regulatory protein CpxR  57.71 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0252  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000571082  hitchhiker  0.000346333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3769  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000556998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0253  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000454029  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0261  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000361731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0367  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000100212  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2279  DNA-binding response regulator  50.66 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  51.56 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  51.56 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31150  Response regulator  46.72 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0987  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 		 235 aa  221  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000260123  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  48.9 
 
 		 232 aa  218  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00535  Transcriptional regulatory protein CpxR  51.75 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2970  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.068725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3793  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.37 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4460  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2572  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186253 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6145  two component response regulator  47.16 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1750  transcriptional regulatory protein CpxR  48.05 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000216865  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03088  two-component response regulator transcription regulator protein  45.85 
 
 		 246 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.25081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  48.9 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3372  winged helix family two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.690812  normal  0.187928 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.7 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7488  two component response regulator  44.54 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6517  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0325894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2386  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.3038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0716  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 233 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0704  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.67 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.710027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3275  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000116561  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3185  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.729743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4009  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 225 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597595  hitchhiker  0.0000110419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15610  Response regulator, transciptional regulatory protein  46.22 
 
 		 225 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0572115  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3195  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.688912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22760  putative two-component response regulator  46.67 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0539892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1483  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 225 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0288957  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0319  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 223 aa  187  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000369721  hitchhiker  0.00000000968682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3792  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000277452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000423816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1922  putative two-component response regulator  46.22 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1831  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.989444  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1008  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1223  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 		 234 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3452  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2301  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3589  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.78 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110518  normal  0.715571 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1313  transcriptional regulatory protein CpxR  42.79 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.186950000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1424  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00122466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2753  transcriptional regulatory protein CpxR  42.79 
 
 		 227 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 239 aa  178  8e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.35 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  44.35 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  44.35 
 
 		 239 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>