More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002122 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  100 
 
 
335 aa  704    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  84.57 
 
 
329 aa  588  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  60.25 
 
 
338 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  48.57 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
327 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 
327 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  42.11 
 
 
327 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  41.78 
 
 
327 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  41.39 
 
 
327 aa  235  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 
329 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  40.33 
 
 
329 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
337 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
337 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
337 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  40.37 
 
 
331 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  40.37 
 
 
337 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  40.37 
 
 
331 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 
317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  39.68 
 
 
345 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  39.68 
 
 
345 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  35.41 
 
 
638 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  39.79 
 
 
329 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 
324 aa  216  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  38.46 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  38.65 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  35.39 
 
 
333 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  37.15 
 
 
330 aa  208  8e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
364 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  36.81 
 
 
324 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  37.61 
 
 
338 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  37.61 
 
 
338 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  37.61 
 
 
338 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  37.61 
 
 
338 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  37.61 
 
 
338 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  37.5 
 
 
340 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  37.5 
 
 
340 aa  205  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  37.5 
 
 
340 aa  205  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  37.5 
 
 
340 aa  205  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  37.5 
 
 
340 aa  205  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  37.5 
 
 
340 aa  205  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  37.5 
 
 
340 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  37.5 
 
 
340 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  37.5 
 
 
340 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  36.18 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  34.86 
 
 
334 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  35.71 
 
 
330 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  39.86 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  37.36 
 
 
318 aa  182  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  32.31 
 
 
322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  35.13 
 
 
303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  35.19 
 
 
330 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  34.63 
 
 
331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  34.63 
 
 
331 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
323 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  34.09 
 
 
315 aa  132  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  29.39 
 
 
329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
314 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  31.27 
 
 
320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
314 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
333 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  28.65 
 
 
337 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
314 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  33.56 
 
 
315 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 
315 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  34.81 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  34.33 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  34.07 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  31.44 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 
315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 
330 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
317 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
320 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
329 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
320 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  30.5 
 
 
317 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
345 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
290 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.17 
 
 
291 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  29.74 
 
 
330 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
284 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1375  Lysophospholipase  25.09 
 
 
363 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  25.44 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  27.36 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  25.26 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
263 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  23.97 
 
 
300 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>