More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002071 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  100 
 
 
127 aa  247  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  91.34 
 
 
127 aa  233  5.0000000000000005e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  79.2 
 
 
126 aa  201  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  70.97 
 
 
126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  52.46 
 
 
127 aa  123  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  52.07 
 
 
128 aa  122  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  52.59 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  53.33 
 
 
133 aa  106  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 
124 aa  103  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  49.14 
 
 
124 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
127 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
124 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  46.49 
 
 
123 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 
124 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 
124 aa  96.3  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  46.55 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  42.45 
 
 
228 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  43.59 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.86 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 
124 aa  84.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  46.55 
 
 
122 aa  84  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  45.69 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.34 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  40.57 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.16 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  34.92 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 
123 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  37.39 
 
 
116 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.46 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  41.9 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.07 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  48.75 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  35.14 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.84 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  42.72 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  37 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  34.92 
 
 
270 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  34.68 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  41.75 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  35.83 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
147 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  40.71 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  43.33 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  37.93 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  37.61 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  37.61 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  38.33 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.74 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  41.12 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>