61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002023 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  100 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  94.64 
 
 
129 aa  212  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  77.68 
 
 
129 aa  173  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2521  F0F1 ATP synthase subunit I  81.91 
 
 
129 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  43.33 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  39.77 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  43.33 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  39.77 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  39.77 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  39.77 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  37.14 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  37.74 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  39.77 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  37.14 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  39.77 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  39.77 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  39.77 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73320  F0F1 ATP synthase subunit I  43.48 
 
 
126 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691131  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  36.19 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6363  F0F1 ATP synthase subunit I  45.88 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  40 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2917  hypothetical protein  33.64 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3060  hypothetical protein  33.64 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3312  ATP synthase protein I, putative  45.57 
 
 
125 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.26583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  36.36 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  35.24 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52230  ATP synthase I chain  41.3 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  41.94 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  41.94 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  41.94 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  34.74 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5420  F0F1 ATP synthase subunit I  41.3 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5302  F0F1 ATP synthase subunit I  41.3 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244326  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5438  F0F1 ATP synthase subunit I  41.3 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  41.3 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  41.86 
 
 
135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3737  ATP synthase I chain  31.73 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383514  normal  0.351861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  41.86 
 
 
135 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  40.86 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5737  F0F1 ATP synthase subunit I  39.53 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016778  normal  0.424029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  42.7 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4125  F0F1 ATP synthase subunit I  39.42 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  43.21 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  40.45 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3882  ATP synthase I chain  37.88 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0112913  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2141  ATP synthase F0, I subunit  34.48 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0183  ATP synthase protein I  34.48 
 
 
161 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.682673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3901  ATP synthase I chain  41.33 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0055  ATP synthase protein I  30.85 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0033  putative ATP synthase protein I  40 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337462  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3034  ATP synthase I chain  38.67 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4187  F0F1 ATP synthase subunit I  42.03 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000826403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03567  hypothetical protein  35.58 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000214026  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  35.58 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721396  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4228  ATP synthase I chain  35.58 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4182  F0F1 ATP synthase subunit I  35.58 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000328591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  35.58 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000153619  normal  0.0333498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03623  F0F1 ATP synthase subunit I  35.58 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000273392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3955  F0F1 ATP synthase subunit I  35.58 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3291  ATP synthase I chain  34.25 
 
 
161 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2437  ATP synthase I chain  34.38 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.317288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>