More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002022 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  100 
 
 
293 aa  583  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  94.88 
 
 
293 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  75.34 
 
 
293 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  66.78 
 
 
294 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  57.04 
 
 
294 aa  324  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  57.34 
 
 
290 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04091  ParB family protein  58.62 
 
 
292 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00869743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3964  parB-like partition protein  55.1 
 
 
292 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.20429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  54.3 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  54.3 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  54.3 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  54.42 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  54.42 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  54.3 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  54.42 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4755  ParB family protein  54.42 
 
 
292 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3652  ParB family protein  53.61 
 
 
292 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0209333  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  54.3 
 
 
294 aa  298  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  53.77 
 
 
296 aa  296  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  55.36 
 
 
292 aa  295  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  55.71 
 
 
300 aa  294  1e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  53.26 
 
 
294 aa  292  4e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4053  parB-like partition proteins  53.61 
 
 
293 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  49.83 
 
 
294 aa  265  8e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  51.58 
 
 
290 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  50.53 
 
 
289 aa  261  8e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  51.58 
 
 
290 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  50.7 
 
 
290 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  50.7 
 
 
290 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  49.49 
 
 
295 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  48.33 
 
 
304 aa  258  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  48.3 
 
 
291 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2595  parB-like partition protein  50.17 
 
 
280 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0581078  normal  0.0919239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  53.19 
 
 
290 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  46.88 
 
 
283 aa  255  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  53.19 
 
 
290 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  48.99 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  48.01 
 
 
290 aa  251  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  48.01 
 
 
288 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  53.29 
 
 
294 aa  251  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  47.26 
 
 
295 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  46.92 
 
 
295 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  46.92 
 
 
295 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  46.92 
 
 
295 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  46.92 
 
 
295 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  46.92 
 
 
295 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  46.92 
 
 
295 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  46.92 
 
 
295 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  46.58 
 
 
305 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  46.49 
 
 
303 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  46.58 
 
 
297 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  46.58 
 
 
297 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  46.58 
 
 
305 aa  245  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0065  chromosome partitioning protein  45.2 
 
 
315 aa  245  6.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.446293  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0033  ParB-like partition domain-containing protein  45.2 
 
 
289 aa  245  8e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5738  chromosome segregation DNA-binding protein  51.93 
 
 
290 aa  245  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193091  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5607  ParB family protein  50.53 
 
 
290 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  44.48 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  46.92 
 
 
310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5129  ParB-like partition protein  50.53 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  46.33 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  46.33 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  44.81 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  45.21 
 
 
295 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3738  parB-like partition proteins  48.83 
 
 
305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.927057  normal  0.412058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  46.28 
 
 
309 aa  239  4e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  45.55 
 
 
284 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  45.89 
 
 
295 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  48.21 
 
 
289 aa  237  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  48.81 
 
 
301 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  46.71 
 
 
286 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  46.23 
 
 
297 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2438  parB-like partition proteins  45.15 
 
 
297 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.291744  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2877  parB-like partition proteins  46.55 
 
 
287 aa  229  4e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.754153  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1319  chromosome segregation DNA-binding protein  47.17 
 
 
375 aa  229  5e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  45.89 
 
 
297 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  45.89 
 
 
305 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1059  parB-like partition proteins  47.17 
 
 
371 aa  228  9e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  45.49 
 
 
362 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0004  ParB family protein  44.75 
 
 
282 aa  225  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.177803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  47.96 
 
 
313 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0078  chromosome segregation DNA-binding protein  48.13 
 
 
311 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0001  hypothetical protein  41.96 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.115851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2515  chromosome segregation DNA-binding protein  42.09 
 
 
294 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411108  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1068  parB-like partition proteins  47.57 
 
 
303 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  47.28 
 
 
300 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3354  chromosome segregation DNA-binding protein  48.15 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1473  chromosome partitioning protein  44.55 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2174  parB-like partition proteins  42.09 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000145902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2334  parB-like partition protein  40.68 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000401981  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1399  parB-like partition protein  44.37 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0050  parB-like partition protein  41.88 
 
 
315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.99928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0068  parB-like partition proteins  46.84 
 
 
311 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  44.52 
 
 
311 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  41.9 
 
 
294 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  41.9 
 
 
294 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  46.84 
 
 
303 aa  208  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  43.1 
 
 
331 aa  208  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  43.42 
 
 
313 aa  206  4e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3934  parB-like partition protein  40.88 
 
 
295 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0273178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>