More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002015 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002015  YidD  100 
 
 		 85 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000175074  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3867  hypothetical protein  62.35 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000433459  unclonable  0.00000248153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4247  hypothetical protein  60 
 
 		 85 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000493457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0010  hypothetical protein  58.82 
 
 		 84 aa  110  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000352572  hitchhiker  0.000527838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0005  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4522  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000187641  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4381  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000226014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4380  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000121498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4003  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670472  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4326  protein of unknown function DUF37  60 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160974  unclonable  0.00000000000183144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3941  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000010216  unclonable  0.0000000000204685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4033  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000274009  hitchhiker  0.00014968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0007  hypothetical protein  60 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000225175  unclonable  0.0000000000348643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4258  hypothetical protein  60.53 
 
 		 84 aa  107  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000431674  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0134  hypothetical protein  55.29 
 
 		 86 aa  107  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000169142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4064  hypothetical protein  58.82 
 
 		 84 aa  105  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000197043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3610  hypothetical protein  62.32 
 
 		 79 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4150  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000545149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3776  hypothetical protein  57.65 
 
 		 84 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000347522  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03588  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308297  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03532  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3918  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000385576  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4290  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00071017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4930  hypothetical protein  59.3 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000391047  unclonable  0.00000000644601 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0003  hypothetical protein  58.14 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000613833  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4265  protein of unknown function DUF37  55.29 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000434103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4036  protein of unknown function DUF37  52.94 
 
 		 85 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.391215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0029  hypothetical protein  61.18 
 
 		 85 aa  97.8  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0101085  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  54.55 
 
 		 92 aa  97.1  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5051  hypothetical protein  53.09 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0820825  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  56.76 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  55.41 
 
 		 99 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1884  hypothetical protein  56.76 
 
 		 105 aa  93.6  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0689122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4313  hypothetical protein  50.6 
 
 		 84 aa  93.6  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00601165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9388  hypothetical protein  53.42 
 
 		 92 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1890  hypothetical protein  56.94 
 
 		 91 aa  90.9  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3594  hypothetical protein  45.88 
 
 		 107 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.618797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  56 
 
 		 78 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  56 
 
 		 78 aa  90.1  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  56 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  56 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  56 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  55.56 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  56 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2159  hypothetical protein  54.93 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  56 
 
 		 78 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  56.16 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  56.16 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2031  hypothetical protein  56.52 
 
 		 94 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  56.16 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4983  protein of unknown function DUF37  56.16 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  56.16 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  53.62 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  57.75 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4621  hypothetical protein  54.41 
 
 		 81 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2562  protein of unknown function DUF37  53.52 
 
 		 92 aa  88.6  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2922  protein of unknown function DUF37  51.39 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241578  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4511  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23460  conserved hypothetical protein TIGR00278  55.88 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4150  protein of unknown function DUF37  63.08 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  54.55 
 
 		 69 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  53.62 
 
 		 81 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  55.22 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2596  hypothetical protein  59.09 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  53.33 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  60.61 
 
 		 92 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  55.56 
 
 		 86 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3944  hypothetical protein  58.21 
 
 		 70 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  59.09 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0355  protein of unknown function DUF37  50 
 
 		 79 aa  85.5  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.437733  normal  0.0683949 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1845  hypothetical protein  54.55 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  51.35 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1881  hypothetical protein  54.55 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.663479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4015  hypothetical protein  60.94 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20976  normal  0.241605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5109  hypothetical protein  46.43 
 
 		 95 aa  84  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.107467  unclonable  0.0000000143514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50.7 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4866  protein of unknown function DUF37  54.29 
 
 		 107 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000436538  normal  0.0104402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  54.55 
 
 		 70 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4540  hypothetical protein  58.67 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  54.55 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3398  hypothetical protein  42.5 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  52.94 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2130  hypothetical protein  53.85 
 
 		 86 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000561548  normal  0.554257 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  57.81 
 
 		 82 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1538  protein of unknown function DUF37  58.21 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000355677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4170  hypothetical protein  53.42 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0260049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  54.55 
 
 		 69 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  54.41 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3935  protein of unknown function DUF37  53.33 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000438266 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  52.94 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  49.33 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  54.41 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  49.3 
 
 		 98 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4906  hypothetical protein  51.47 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.466234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6485  hypothetical protein  53.73 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00221195  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0101  hypothetical protein  59.68 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0303  hypothetical protein  45.95 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  52 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2845  hypothetical protein  45.95 
 
 		 89 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.642918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>