More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001891 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  66.8 
 
 
497 aa  664  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.9107e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  71.31 
 
 
519 aa  680  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  100 
 
 
500 aa  1014  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  68.15 
 
 
521 aa  665  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  78 
 
 
499 aa  783  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  66.8 
 
 
497 aa  665  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  68.99 
 
 
511 aa  673  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  68.15 
 
 
521 aa  665  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  69.28 
 
 
520 aa  684  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  68.29 
 
 
521 aa  671  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  69.11 
 
 
514 aa  689  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  68.29 
 
 
521 aa  669  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  68.5 
 
 
521 aa  671  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  71.02 
 
 
525 aa  671  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  69.11 
 
 
514 aa  678  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  68.9 
 
 
523 aa  676  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  68.02 
 
 
521 aa  662  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  67 
 
 
497 aa  666  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  68.15 
 
 
521 aa  665  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  66.8 
 
 
497 aa  642  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  67.89 
 
 
524 aa  666  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  69.22 
 
 
523 aa  687  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  68.15 
 
 
521 aa  665  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  69.8 
 
 
509 aa  659  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  68.5 
 
 
521 aa  671  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  68.57 
 
 
523 aa  669  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  66.8 
 
 
497 aa  664  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.37275e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  83.71 
 
 
503 aa  835  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  95.59 
 
 
501 aa  971  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  65.91 
 
 
498 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  63.92 
 
 
520 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  63.86 
 
 
502 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  63.39 
 
 
502 aa  613  1e-174  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  64.78 
 
 
498 aa  608  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  63.73 
 
 
518 aa  608  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  64.55 
 
 
515 aa  607  1e-172  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  64.01 
 
 
495 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  60.82 
 
 
489 aa  585  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  58.56 
 
 
522 aa  585  1e-166  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  60.82 
 
 
490 aa  583  1e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  60.57 
 
 
501 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  62.14 
 
 
498 aa  581  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  62.55 
 
 
498 aa  576  1e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  58.06 
 
 
494 aa  565  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  57.32 
 
 
494 aa  558  1e-158  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  57.79 
 
 
503 aa  561  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0142  general secretory pathway protein E  58.32 
 
 
502 aa  555  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  57.11 
 
 
494 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  58.08 
 
 
484 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  58.28 
 
 
493 aa  539  1e-152  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  58.28 
 
 
493 aa  539  1e-152  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  58.28 
 
 
493 aa  539  1e-152  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  58.28 
 
 
493 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  58.28 
 
 
493 aa  538  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0954  general secretory pathway protein E  57.11 
 
 
503 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.120459  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3268  general secretion pathway protein E  57.11 
 
 
503 aa  518  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.98586e-06  hitchhiker  1.27286e-14 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1005  type II secretion system protein E  57.11 
 
 
503 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  53.21 
 
 
513 aa  515  1e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  54.36 
 
 
491 aa  517  1e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  53.74 
 
 
515 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  7.85682e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  53.13 
 
 
491 aa  505  1e-142  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  52.54 
 
 
495 aa  505  1e-142  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  52.97 
 
 
498 aa  503  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  52.73 
 
 
497 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  52.73 
 
 
497 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  52.74 
 
 
522 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  52.73 
 
 
497 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  52.73 
 
 
497 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  52.73 
 
 
497 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  52.73 
 
 
497 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  52.73 
 
 
497 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  52.97 
 
 
487 aa  502  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  53.07 
 
 
497 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  53.39 
 
 
518 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  53.06 
 
 
499 aa  499  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  52.86 
 
 
499 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  53.65 
 
 
599 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  52.35 
 
 
499 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  52.47 
 
 
477 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  53.65 
 
 
599 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  52.99 
 
 
518 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  52.35 
 
 
499 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  52.65 
 
 
499 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  52.29 
 
 
499 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  52.76 
 
 
471 aa  491  1e-138  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  51.23 
 
 
486 aa  494  1e-138  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  52.34 
 
 
474 aa  494  1e-138  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  53.43 
 
 
599 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  53.96 
 
 
507 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  53.32 
 
 
474 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  53.27 
 
 
533 aa  488  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  51.55 
 
 
497 aa  484  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  52.16 
 
 
505 aa  483  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  51.95 
 
 
463 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  51.41 
 
 
469 aa  482  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  48.99 
 
 
603 aa  479  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  55.85 
 
 
483 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  55.85 
 
 
482 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  51.32 
 
 
469 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  51.53 
 
 
469 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>