79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001886 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  100 
 
 
225 aa  465  1e-130  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  80.38 
 
 
250 aa  358  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  64.68 
 
 
221 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  54.03 
 
 
215 aa  244  5e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  45.41 
 
 
216 aa  174  1e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  45.27 
 
 
216 aa  172  4e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  41.38 
 
 
219 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  38.02 
 
 
237 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  39.07 
 
 
246 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  37.38 
 
 
211 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  36.45 
 
 
232 aa  139  5e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  33.94 
 
 
241 aa  135  3e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  34.98 
 
 
259 aa  135  7e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  35.58 
 
 
208 aa  133  2e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
236 aa  132  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  38.19 
 
 
199 aa  130  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  34.5 
 
 
259 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
250 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  33.5 
 
 
252 aa  122  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  30.48 
 
 
251 aa  120  1e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  36 
 
 
199 aa  120  1e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  36 
 
 
201 aa  120  2e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  32.65 
 
 
253 aa  120  2e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  35.53 
 
 
201 aa  120  2e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  31.03 
 
 
264 aa  120  2e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  36 
 
 
199 aa  120  2e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  31.34 
 
 
255 aa  120  2e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  32.14 
 
 
255 aa  119  4e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  32.14 
 
 
253 aa  119  5e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  34.31 
 
 
197 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  32.14 
 
 
257 aa  117  1e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  32.14 
 
 
263 aa  116  2e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  32.14 
 
 
259 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  32.14 
 
 
259 aa  117  2e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  34.26 
 
 
239 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  34.92 
 
 
189 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.4032e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  34.22 
 
 
187 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  5.3878e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  30.52 
 
 
237 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  30.48 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  28.9 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  26.94 
 
 
254 aa  84  2e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  28.82 
 
 
253 aa  73.9  2e-12  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  28.86 
 
 
199 aa  70.1  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  32.54 
 
 
204 aa  70.1  3e-11  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  25.35 
 
 
195 aa  68.9  6e-11  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  24.21 
 
 
198 aa  68.9  6e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  25.35 
 
 
195 aa  67.8  1e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  25.35 
 
 
195 aa  67.8  1e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  25.35 
 
 
195 aa  67.8  1e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  25.35 
 
 
195 aa  67.8  1e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  23.68 
 
 
198 aa  67.4  2e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  24.52 
 
 
212 aa  61.6  9e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.92779e-07 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  25.81 
 
 
198 aa  60.5  2e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0321  general secretion pathway protein J  26.88 
 
 
203 aa  57  2e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  26.98 
 
 
220 aa  55.8  5e-07  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  26.57 
 
 
205 aa  55.8  6e-07  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  24.75 
 
 
181 aa  55.5  6e-07  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  26.57 
 
 
205 aa  55.1  9e-07  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  38.33 
 
 
202 aa  53.9  2e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  29.85 
 
 
223 aa  52.4  5e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  25.73 
 
 
193 aa  50.4  2e-05  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0651  hypothetical protein  38.33 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  21.74 
 
 
206 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  22.34 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55530  putative type II secretion system protein  27.81 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0378882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  34.21 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  26.42 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  26.61 
 
 
131 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  8.9395e-09  hitchhiker  3.09054e-15 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0672  hypothetical protein  36.84 
 
 
227 aa  45.4  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.142154  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  26.46 
 
 
202 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  30 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1035  hypothetical protein  27.94 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  29.79 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  37.88 
 
 
127 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0589  N-terminal methylation protein  29.9 
 
 
201 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2835  hypothetical protein  44.9 
 
 
195 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.486076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2614  putative general secretion pathway protein J  23.5 
 
 
237 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2535  general secretory pathway protein J  24.39 
 
 
223 aa  42  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0358104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  37.88 
 
 
129 aa  41.6  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>