More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001854 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001854  putative transmembrane ABC transporter protein  100 
 
 
341 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00639  ABC transporter permease component  98.24 
 
 
341 aa  681    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0871  inner membrane ABC transporter permease protein  78.72 
 
 
342 aa  565  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.57 
 
 
338 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
344 aa  301  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
344 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00114687  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.61 
 
 
344 aa  289  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.291354  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.564581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
345 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000273194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.9 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.94 
 
 
350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.431982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.94 
 
 
342 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.552398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2992  ABC transporter, inner membrane subunit  40.63 
 
 
350 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712485  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5000  ABC transporter, inner membrane subunit  41.33 
 
 
350 aa  272  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47497  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
350 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
350 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.673623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
350 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1174  transmembrane ABC transporter protein  41.26 
 
 
351 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000600892  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
349 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1855  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.8 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.685434  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.46 
 
 
350 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106153  normal  0.226487 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
354 aa  268  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
345 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2128  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.8 
 
 
350 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.385957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
350 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.939942  decreased coverage  0.0094028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.38 
 
 
350 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.651204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1637  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  41.81 
 
 
345 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.648202  normal  0.318212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
345 aa  262  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0191785  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1381  ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 
346 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.238328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3205  ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 
346 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000674085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2546  ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 
346 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00426967  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0290  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  39.55 
 
 
358 aa  260  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2108  ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 
346 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366053  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2492  ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 
346 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0860653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2634  putative ABC transport system, membrane protein  41.23 
 
 
455 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0725782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
347 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
346 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00200208  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2080  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
347 aa  258  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338378  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
347 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.658809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
347 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.251429  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
347 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0008  ABC transporter, permease protein  40.5 
 
 
365 aa  258  1e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1979  ABC transporter, permease protein  41.23 
 
 
370 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000494739  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0008  ABC transporter, permease protein  40.5 
 
 
365 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00620347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5370  ABC transporter, inner membrane subunit  40.52 
 
 
347 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190291  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
347 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54297 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
368 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0421438 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29660  oligopeptide ABC transporter, inner membrane permease component  39.83 
 
 
361 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.124853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.06 
 
 
364 aa  255  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0654461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1757  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.83 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.443887  normal  0.0467925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
352 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
357 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0120356  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
357 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552339  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41140  ABC transporter permease  39.55 
 
 
360 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0534  putative peptide ABC transporter, permease protein  39.17 
 
 
360 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
361 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
352 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3718  ABC transporter, permease protein  39.55 
 
 
357 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.11 
 
 
357 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.270311  normal  0.8272 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3487  ABC transporter permease  39.28 
 
 
360 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
357 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285143  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
345 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.14249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3742  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.62 
 
 
354 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234646  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
352 aa  251  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.74003  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
352 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.124868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.9 
 
 
368 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
347 aa  250  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3247  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
364 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559652  normal  0.0140397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.94 
 
 
360 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37870  putative peptide ABC transporter, permease protein  40.28 
 
 
357 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000955556  normal  0.178623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
345 aa  248  8e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0525112  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0344  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
365 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
365 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0266  peptide ABC transporter, permease protein  39.09 
 
 
355 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
365 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0428619  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2433  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
365 aa  246  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3030  peptide ABC transporter, permease protein  39.2 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2903  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.2 
 
 
354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00817715  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1496  ABC transporter permease  38.02 
 
 
366 aa  245  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
366 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.399987  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2712  ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
366 aa  245  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0140  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.09 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3119  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.77 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
363 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2180  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.03 
 
 
357 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.776832 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
363 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.48 
 
 
369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.02836 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
362 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0703  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.85 
 
 
362 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
362 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0883439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4133  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
362 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
369 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3167  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.84 
 
 
367 aa  240  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.127816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>