More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001802 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0047  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  80.37 
 
 
386 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001802  putative aminotransferase DegT family  100 
 
 
383 aa  803    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0252  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  80.58 
 
 
381 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0171  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  80.58 
 
 
381 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00668  UDP-bacillosamine synthetase  81.98 
 
 
383 aa  676    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2329  pyridoxal phosphate-dependent enzyme apparently involved in regulation of cell wall biogenesis  71.58 
 
 
385 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3098  UDP-bacillosamine synthetase  70.37 
 
 
385 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1586  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  68.7 
 
 
382 aa  564  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.257863  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3119  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  59.47 
 
 
391 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2975  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  59.47 
 
 
391 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0369  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  61.23 
 
 
389 aa  461  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0593  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.65 
 
 
383 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  53.17 
 
 
384 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2305  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  51.21 
 
 
383 aa  423  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4084  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  53.74 
 
 
392 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2587  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.26 
 
 
383 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0384123  hitchhiker  0.000234634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0525  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  53.78 
 
 
395 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  52.02 
 
 
394 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1461  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  49.21 
 
 
399 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2405  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.38 
 
 
402 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.12432  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0393  aminotransferase  43.01 
 
 
380 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1514  aminotransferase  42.47 
 
 
381 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01121  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  44.74 
 
 
395 aa  309  5e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.273629 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12411  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.71 
 
 
407 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.485468  hitchhiker  0.0071561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4858  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.5 
 
 
395 aa  293  4e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707328  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14101  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  41.03 
 
 
398 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1974  DegT/DnrJ/EryC1/StrS family protein  41.89 
 
 
384 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.953061  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5132  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.23 
 
 
380 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16970  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.88 
 
 
391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0563  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.06 
 
 
381 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3134  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.77 
 
 
368 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2577  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.4 
 
 
365 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.176672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0752  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.44 
 
 
368 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.582657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2766  perosamine synthetase  38.89 
 
 
368 aa  240  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0950  putative perosamine synthetase  34.65 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.251305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3253  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.68 
 
 
384 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2600  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  35.73 
 
 
362 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.11 
 
 
372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0334323  normal  0.0133651 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0289  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.54 
 
 
367 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5394  aminotransferase family protein  36.52 
 
 
371 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3387  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.84 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3629  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  37.88 
 
 
372 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0521  perosamine synthase, putative  34.82 
 
 
367 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1139  general glycosylation pathway protein  35.11 
 
 
386 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.957255  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1264  general glycosylation pathway protein  34.22 
 
 
386 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.905092  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0599  general glycosylation pathway protein  33.95 
 
 
386 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0714  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.31 
 
 
375 aa  226  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2644  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.7 
 
 
389 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2521  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.98 
 
 
369 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162044 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1203  putative perosamine synthetase  34.54 
 
 
363 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1355  perosamine synthetase, putative  32.68 
 
 
364 aa  220  3.9999999999999997e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0448  processing protease  34.26 
 
 
363 aa  218  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.29 
 
 
379 aa  216  4e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3048  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.46 
 
 
382 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0312  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.9 
 
 
387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.991338  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0821  hypothetical protein  32.71 
 
 
500 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10738  putative aminotransferase  37.54 
 
 
365 aa  215  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.250686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2345  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.97 
 
 
382 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2970  aminotransferase, DegT/DnrJ/EryC1/StrS family  33.88 
 
 
364 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000014581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0792  hypothetical protein  32.88 
 
 
500 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1257  UDP-4-keto-6-deoxy-GlcNAc C4 aminotransferase  33.25 
 
 
386 aa  210  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3402  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.68 
 
 
507 aa  209  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1573  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.2 
 
 
500 aa  209  9e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0361  aminotransferase-like  33.06 
 
 
383 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2633  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  34.41 
 
 
390 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.152572  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2570  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.53 
 
 
372 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0334  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.74 
 
 
377 aa  206  8e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.272347  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3986  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  36.51 
 
 
383 aa  203  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1213  cell wall biosynthesis enzyme  33.52 
 
 
368 aa  203  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.578129  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3061  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.52 
 
 
393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1969  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  35.91 
 
 
384 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.886816  normal  0.342999 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2624  perosamine synthase  31.87 
 
 
367 aa  199  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0486  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.38 
 
 
403 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3059  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.74 
 
 
370 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3652  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.07 
 
 
403 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0082  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.09 
 
 
371 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0080  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  31.09 
 
 
371 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3157  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  33.52 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0056  perosamine synthetase  31.02 
 
 
375 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0267366  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3378  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.41 
 
 
368 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.65764  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0874  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.68 
 
 
366 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0364  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.89 
 
 
383 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3898  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.15 
 
 
388 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4737  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.77 
 
 
383 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.301664 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3660  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.77 
 
 
383 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795674  normal  0.3486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4213  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.81 
 
 
382 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5255  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  32.93 
 
 
381 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.11 
 
 
366 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.281865  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0346  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.06 
 
 
383 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  28.61 
 
 
372 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0110  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.58 
 
 
406 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1998  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  28.03 
 
 
389 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  29.91 
 
 
373 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4504  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.23 
 
 
382 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0669579  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1938  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  31.37 
 
 
397 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1393  glutamine--scyllo-inositol transaminase  32.71 
 
 
392 aa  167  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1039  glutamine--scyllo-inositol transaminase  30.86 
 
 
394 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000569321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1964  perosamine synthetase  27.13 
 
 
591 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1981  perosamine synthetase  27.61 
 
 
591 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0571  aminotransferase  27.13 
 
 
586 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>