57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001713 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  80.81 
 
 		 250 aa  301  4.0000000000000003e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  42.33 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  31.76 
 
 		 237 aa  96.3  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  35.06 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  31.37 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  29.14 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  29.14 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  37.65 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  31.71 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  38.37 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  38.37 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  38.37 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  38.37 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  38.37 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  26.09 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  36.47 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  24.21 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  24.21 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  24.21 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  34.12 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  34.12 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  34.12 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  23.68 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  30 
 
 		 402 aa  58.9  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  28.03 
 
 		 418 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  27.74 
 
 		 439 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  27.14 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  32.93 
 
 		 459 aa  51.2  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  23.45 
 
 		 441 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  33.8 
 
 		 468 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  34.25 
 
 		 475 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  33.8 
 
 		 447 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  27.04 
 
 		 428 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  25 
 
 		 460 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  26.49 
 
 		 429 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  27.69 
 
 		 470 aa  45.1  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  25.98 
 
 		 475 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  25.58 
 
 		 475 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  34.62 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  23.84 
 
 		 418 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  33.77 
 
 		 439 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  25.49 
 
 		 423 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  33.77 
 
 		 439 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  33.77 
 
 		 439 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  33.77 
 
 		 439 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  33.77 
 
 		 439 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  33.8 
 
 		 440 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  33.8 
 
 		 419 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  42  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  42  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  25.33 
 
 		 434 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>