267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001668 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  93.08 
 
 
159 aa  316  7e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  75.47 
 
 
165 aa  258  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  69.94 
 
 
173 aa  253  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  61.21 
 
 
170 aa  213  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  55.9 
 
 
163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  58.13 
 
 
160 aa  193  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  57.5 
 
 
160 aa  192  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  57.5 
 
 
160 aa  192  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  57.5 
 
 
160 aa  192  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  62.59 
 
 
160 aa  192  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  57.86 
 
 
160 aa  190  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  58.13 
 
 
160 aa  188  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  55 
 
 
165 aa  187  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  52.83 
 
 
162 aa  186  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  59.48 
 
 
160 aa  186  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  54.37 
 
 
160 aa  186  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  55 
 
 
160 aa  185  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  58.13 
 
 
160 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  63.38 
 
 
160 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  65.15 
 
 
160 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  55.97 
 
 
160 aa  184  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  56.25 
 
 
160 aa  184  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  57.5 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  61.97 
 
 
160 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  56.88 
 
 
160 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  56.25 
 
 
160 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  54.09 
 
 
159 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  56.25 
 
 
160 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
159 aa  177  4e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
196 aa  177  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
159 aa  177  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
159 aa  177  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
159 aa  177  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
196 aa  177  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  52.2 
 
 
159 aa  177  4e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  55.92 
 
 
160 aa  177  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
196 aa  176  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  51.57 
 
 
159 aa  176  9e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  52.83 
 
 
159 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  52.83 
 
 
159 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  52.83 
 
 
159 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  52.83 
 
 
159 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  52.83 
 
 
159 aa  176  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  53.46 
 
 
160 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  51.19 
 
 
171 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  55.62 
 
 
160 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  49.4 
 
 
169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  53.33 
 
 
167 aa  169  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
162 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
162 aa  166  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  48.45 
 
 
161 aa  166  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  164  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
162 aa  164  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  51.33 
 
 
161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  48.12 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
162 aa  161  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 
171 aa  160  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  50.31 
 
 
161 aa  159  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 
170 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  48.12 
 
 
164 aa  156  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  45 
 
 
166 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.38 
 
 
166 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.88 
 
 
174 aa  155  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5184  dihydrofolate reductase  46.99 
 
 
171 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128106  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
177 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  47.47 
 
 
166 aa  152  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
163 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  45.57 
 
 
166 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
172 aa  152  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
166 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  51.52 
 
 
176 aa  151  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
170 aa  151  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5361  dihydrofolate reductase  46.71 
 
 
170 aa  151  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.91 
 
 
167 aa  150  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0333  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 
171 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  44.94 
 
 
166 aa  150  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5132  dihydrofolate reductase  46.39 
 
 
171 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.632435  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  44.03 
 
 
166 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1041  dihydrofolate reductase  50.96 
 
 
166 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1082  dihydrofolate reductase  50 
 
 
166 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
167 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  47.5 
 
 
166 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  43.56 
 
 
167 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  43.83 
 
 
163 aa  148  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4196  dihydrofolate reductase  48.75 
 
 
166 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1259  dihydrofolate reductase  47.02 
 
 
166 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
167 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  48.1 
 
 
163 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>