More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001623 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  58.26 
 
 
581 aa  715  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.92318e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  56.05 
 
 
581 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  58.09 
 
 
581 aa  712  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.72934e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  58.26 
 
 
581 aa  715  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.06976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  54.53 
 
 
584 aa  651  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  58.08 
 
 
582 aa  705  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  57.82 
 
 
584 aa  701  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  58.26 
 
 
581 aa  715  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  2.2434e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  75.51 
 
 
586 aa  945  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  58.33 
 
 
584 aa  698  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  56.05 
 
 
581 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  56.05 
 
 
581 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  59.52 
 
 
584 aa  699  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  58.02 
 
 
582 aa  703  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.95537e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  56.05 
 
 
581 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.08195e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  58.09 
 
 
581 aa  712  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.4553e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  58.26 
 
 
581 aa  715  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  85.08 
 
 
586 aa  1040  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  100 
 
 
588 aa  1214  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  58.02 
 
 
582 aa  703  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.55759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  58.5 
 
 
584 aa  706  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  58.02 
 
 
581 aa  709  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  75.13 
 
 
609 aa  917  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.33993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  58.43 
 
 
581 aa  717  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.65097e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  58.26 
 
 
581 aa  715  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.61356e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  58.26 
 
 
581 aa  715  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  56.05 
 
 
581 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  58.02 
 
 
582 aa  703  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.22663e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  52.4 
 
 
585 aa  623  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  52.03 
 
 
583 aa  616  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  48.71 
 
 
595 aa  589  1e-167  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  51.34 
 
 
588 aa  590  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  51.2 
 
 
601 aa  587  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  50.6 
 
 
575 aa  586  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  50.6 
 
 
573 aa  585  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  51.44 
 
 
574 aa  575  1e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  50.68 
 
 
576 aa  576  1e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.4448e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  50.93 
 
 
574 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  50.93 
 
 
574 aa  572  1e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  51.28 
 
 
575 aa  572  1e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  50.76 
 
 
574 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.53498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  50.85 
 
 
576 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  50.93 
 
 
574 aa  572  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  50.93 
 
 
574 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  50.93 
 
 
574 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  50.85 
 
 
574 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.82839e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  50.76 
 
 
574 aa  563  1e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  50.34 
 
 
574 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  46.06 
 
 
638 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  44.34 
 
 
651 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  44.99 
 
 
574 aa  516  1e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  55.53 
 
 
664 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  55.3 
 
 
663 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  44.94 
 
 
617 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  42.57 
 
 
582 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  55.1 
 
 
652 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  55.76 
 
 
655 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  54.77 
 
 
660 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  55.43 
 
 
663 aa  495  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  53.44 
 
 
660 aa  493  1e-138  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  54.32 
 
 
660 aa  493  1e-138  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  54.09 
 
 
660 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  43.25 
 
 
571 aa  487  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  51.3 
 
 
656 aa  483  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  44.01 
 
 
577 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  43.57 
 
 
578 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  43.7 
 
 
592 aa  481  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  43.13 
 
 
579 aa  477  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  44.7 
 
 
572 aa  469  1e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  42.44 
 
 
614 aa  471  1e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  44.7 
 
 
553 aa  468  1e-130  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  40.99 
 
 
577 aa  459  1e-128  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  40.99 
 
 
577 aa  459  1e-128  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  43.55 
 
 
613 aa  460  1e-128  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  54.59 
 
 
576 aa  461  1e-128  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.48842e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  47.02 
 
 
666 aa  439  1e-122  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  41.05 
 
 
631 aa  441  1e-122  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  43.84 
 
 
578 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  43.46 
 
 
603 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  43.71 
 
 
565 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  50.7 
 
 
645 aa  430  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  43.59 
 
 
603 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  47.46 
 
 
622 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  43.91 
 
 
603 aa  422  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  47.27 
 
 
622 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  47.46 
 
 
638 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  43.33 
 
 
636 aa  416  1e-115  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  47.68 
 
 
576 aa  417  1e-115  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  45.38 
 
 
660 aa  417  1e-115  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  43.13 
 
 
604 aa  416  1e-115  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  51.44 
 
 
598 aa  417  1e-115  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  46.6 
 
 
800 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  46.6 
 
 
625 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  39.17 
 
 
594 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  46.6 
 
 
625 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  46.89 
 
 
624 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1712  DNA primase  46.89 
 
 
624 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  46.89 
 
 
624 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  46.89 
 
 
624 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  46.89 
 
 
624 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>