More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001582 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
321 aa  647    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  74.77 
 
 
321 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.69 
 
 
309 aa  358  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.49 
 
 
309 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.24 
 
 
309 aa  353  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  59.94 
 
 
307 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.91 
 
 
308 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.23 
 
 
308 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.91 
 
 
308 aa  348  5e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.96 
 
 
308 aa  347  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3144  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.59 
 
 
308 aa  347  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.59 
 
 
308 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.28 
 
 
308 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2510  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.96 
 
 
308 aa  345  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000427922  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  56.33 
 
 
312 aa  343  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  57.59 
 
 
311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.47 
 
 
307 aa  342  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.15 
 
 
307 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.38 
 
 
312 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.05 
 
 
307 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.05 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1353  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.23 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000384606  hitchhiker  0.00895875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1418  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.23 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0628091  normal  0.474151 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.68 
 
 
307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.38 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1406  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.91 
 
 
308 aa  335  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000428424  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  55.28 
 
 
311 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  58.04 
 
 
308 aa  334  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.41 
 
 
307 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  54.83 
 
 
315 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.97 
 
 
311 aa  332  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.97 
 
 
311 aa  331  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.28 
 
 
311 aa  331  9e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.89 
 
 
311 aa  331  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.97 
 
 
311 aa  331  9e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.94 
 
 
311 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.94 
 
 
311 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.94 
 
 
311 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.94 
 
 
311 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  55.94 
 
 
311 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.94 
 
 
311 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.94 
 
 
311 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.97 
 
 
311 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.66 
 
 
311 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.66 
 
 
311 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.52 
 
 
313 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.1 
 
 
310 aa  328  6e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.91 
 
 
309 aa  328  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.04 
 
 
311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.5 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.63 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.45 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.21 
 
 
309 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.45 
 
 
309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  55.45 
 
 
309 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2267  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.04 
 
 
310 aa  325  9e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0336576  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  55.05 
 
 
310 aa  323  2e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  54.75 
 
 
310 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1262  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  50.81 
 
 
314 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1217  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  50.81 
 
 
314 aa  323  3e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.215156  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.7 
 
 
311 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.37 
 
 
310 aa  321  8e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  52.45 
 
 
327 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.21 
 
 
310 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  56.09 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.31 
 
 
314 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0422  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.14 
 
 
310 aa  319  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.89 
 
 
311 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.57 
 
 
310 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2134  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.56 
 
 
317 aa  315  6e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1403  electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.52 
 
 
310 aa  315  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1170  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.91 
 
 
307 aa  315  8e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000857296  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.26 
 
 
310 aa  314  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.11 
 
 
310 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.58 
 
 
313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.22 
 
 
313 aa  312  3.9999999999999997e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.31 
 
 
314 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  52.63 
 
 
314 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  54.57 
 
 
309 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1289  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.92 
 
 
311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.398679  normal  0.0814706 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2173  electron transfer flavoprotein subunit alpha  54.14 
 
 
309 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  54.46 
 
 
309 aa  309  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3730  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  55.84 
 
 
310 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  53.94 
 
 
308 aa  308  8e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  52.2 
 
 
309 aa  308  9e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  56.15 
 
 
310 aa  308  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  55.21 
 
 
310 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  56.41 
 
 
309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  54.04 
 
 
314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0858  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.04 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7803  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.48 
 
 
309 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  56.29 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000408  electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.85 
 
 
308 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3011  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.52 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0738  electron transfer flavoprotein, subunit alpha  56.56 
 
 
311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170682  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1958  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.26 
 
 
310 aa  305  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76693  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4165  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  54.26 
 
 
310 aa  305  6e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2640  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  55.41 
 
 
310 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89185  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5518  electron transfer flavoprotein subunit alpha  55.76 
 
 
310 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  52.37 
 
 
311 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>