More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001527 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  100 
 
 		 397 aa  811    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  75.82 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  71.03 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  57.25 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  57.25 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  57.25 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  57.25 
 
 		 399 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  56.47 
 
 		 398 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  56.75 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  56.75 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  56.5 
 
 		 399 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  55.11 
 
 		 404 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  56.5 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  56 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  55.5 
 
 		 398 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  55.5 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  55.97 
 
 		 398 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  56.25 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  56.47 
 
 		 398 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  55.5 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  55.25 
 
 		 400 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  52.26 
 
 		 412 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2686  acetate kinase  53.1 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.888015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2566  acetate kinase  53.1 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  53.47 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  53.22 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2578  acetate kinase  53.1 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2523  acetate kinase  53.1 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.340235 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  53.35 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2478  acetate kinase  53.1 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.679526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  53.22 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02221  acetate kinase  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.177023  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1356  acetate kinase  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.446941  normal  0.180313 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1360  acetate kinase  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02181  hypothetical protein  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.154164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  52.85 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2452  acetate kinase  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.691119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2672  acetate kinase  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.733134  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2590  acetate kinase  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0300293  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3436  acetate kinase  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.1925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2446  acetate kinase  52.61 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0138092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  52.11 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  51.6 
 
 		 402 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2559  acetate kinase  51.61 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.139439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  50.75 
 
 		 398 aa  389  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  49.36 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  46.95 
 
 		 398 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  50.75 
 
 		 398 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1484  acetate kinase  52.36 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.209908  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2780  acetate kinase  52.11 
 
 		 400 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0653743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  50.25 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  49.49 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  48.63 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0382  acetate kinase  47.26 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  47.87 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  47.49 
 
 		 404 aa  363  3e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  47.87 
 
 		 403 aa  363  3e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  46.62 
 
 		 398 aa  362  6e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  47.99 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  47.5 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  46.98 
 
 		 395 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  44.56 
 
 		 401 aa  355  7.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  46.62 
 
 		 398 aa  354  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  46.62 
 
 		 398 aa  353  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  48.5 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  46.17 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  45.5 
 
 		 404 aa  352  4e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  44.92 
 
 		 398 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  48.24 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.63 
 
 		 406 aa  352  8e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  47.25 
 
 		 411 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  46.52 
 
 		 406 aa  349  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  45.29 
 
 		 425 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.61 
 
 		 397 aa  348  8e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  46.35 
 
 		 397 aa  348  9e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  43.99 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  46.12 
 
 		 397 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  45.04 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  45.04 
 
 		 415 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  46.25 
 
 		 409 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  46.29 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  47.24 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  44.8 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  45.48 
 
 		 397 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  46.02 
 
 		 402 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  47.73 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  46.1 
 
 		 396 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  44.47 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  45.81 
 
 		 402 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  44.42 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  45.79 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  43.97 
 
 		 421 aa  339  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  44.72 
 
 		 394 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  44.44 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  44.44 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  46.62 
 
 		 398 aa  338  8e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  47.62 
 
 		 408 aa  338  9e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  43.67 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  45.91 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  45.06 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>