More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001453 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  100 
 
 
299 aa  597  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  86.33 
 
 
304 aa  496  1e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  66.22 
 
 
301 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  65.47 
 
 
303 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  65.54 
 
 
301 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  65.95 
 
 
301 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  63 
 
 
302 aa  363  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  62.75 
 
 
300 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  62.75 
 
 
300 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  62.75 
 
 
300 aa  362  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  62.42 
 
 
300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  65.59 
 
 
301 aa  360  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  65.59 
 
 
301 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  65.59 
 
 
301 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  65.59 
 
 
301 aa  358  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  62.63 
 
 
300 aa  348  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  65.95 
 
 
304 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  60.13 
 
 
305 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 
305 aa  332  3e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  60.62 
 
 
302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  60.79 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  63.21 
 
 
299 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  59.11 
 
 
296 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 
311 aa  311  9e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  55.91 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  58.6 
 
 
304 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  58.6 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  60.57 
 
 
297 aa  298  9e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  59.5 
 
 
299 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  54.3 
 
 
306 aa  292  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  55.36 
 
 
298 aa  289  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  56.99 
 
 
309 aa  289  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  54.12 
 
 
302 aa  288  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  60.14 
 
 
299 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  50.5 
 
 
301 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  55.24 
 
 
297 aa  285  8e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  52.33 
 
 
299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  49.66 
 
 
301 aa  281  9e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  57.88 
 
 
297 aa  279  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  57.88 
 
 
297 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  57.88 
 
 
297 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  54.55 
 
 
300 aa  278  7e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  50.52 
 
 
304 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  49.49 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  48.93 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  48.81 
 
 
300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  48.81 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  53.79 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  49.49 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  48.81 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  48.81 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  53.45 
 
 
301 aa  271  7e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  56.83 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  49.66 
 
 
301 aa  269  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  56.47 
 
 
294 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  49.48 
 
 
306 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  49.48 
 
 
306 aa  268  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  48.44 
 
 
302 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  49.64 
 
 
297 aa  265  8e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  48.24 
 
 
313 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  48.24 
 
 
313 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  50.35 
 
 
305 aa  263  3e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  48.47 
 
 
297 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  48.44 
 
 
312 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  46.33 
 
 
301 aa  262  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  48.59 
 
 
311 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  48.24 
 
 
310 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
306 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  48.12 
 
 
300 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  51.96 
 
 
305 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  51.96 
 
 
305 aa  257  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  52.52 
 
 
298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  48.42 
 
 
298 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  48.58 
 
 
298 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  47.51 
 
 
300 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  47.59 
 
 
298 aa  249  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  48.57 
 
 
306 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  39.24 
 
 
315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
315 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  41.24 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
312 aa  211  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  39.33 
 
 
325 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  41.69 
 
 
315 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  41.01 
 
 
302 aa  209  6e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 
323 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 
323 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  42.55 
 
 
302 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  41.43 
 
 
323 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  43.66 
 
 
315 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  44.09 
 
 
317 aa  205  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>