170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001417 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  100 
 
 		 248 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  60.57 
 
 		 251 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  60.16 
 
 		 251 aa  333  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  60.98 
 
 		 250 aa  317  9e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  59.18 
 
 		 247 aa  301  6.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  48.4 
 
 		 252 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  46.37 
 
 		 251 aa  238  5e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  47.6 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  47.6 
 
 		 254 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  46.4 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  47.2 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  47.2 
 
 		 254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  47.15 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  48.98 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  46.58 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  47.13 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  47.58 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  47.58 
 
 		 252 aa  224  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  45.16 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  45.9 
 
 		 249 aa  222  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  43.62 
 
 		 245 aa  221  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  46.56 
 
 		 246 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  42.91 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  43.21 
 
 		 245 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  44.86 
 
 		 245 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  45.68 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  43.62 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  43.62 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  43.62 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  43.62 
 
 		 245 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  45.68 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  44.1 
 
 		 241 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  45.68 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  41.56 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  45.68 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  45.68 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  41.56 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  41.56 
 
 		 245 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  45.68 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  45.68 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  45.68 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  45.68 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  43.21 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  41.56 
 
 		 245 aa  204  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  42.8 
 
 		 245 aa  203  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  41.25 
 
 		 245 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  41.98 
 
 		 244 aa  200  9.999999999999999e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  43.22 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  41.6 
 
 		 240 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  40.76 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  41.18 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  40.59 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  41 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  41.03 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  41.03 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  38.72 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  37.77 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  38.43 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  36.96 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  34.58 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  33.19 
 
 		 236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  29.67 
 
 		 270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  25.88 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  27.94 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  30.51 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  26.47 
 
 		 574 aa  79.3  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  28.46 
 
 		 574 aa  75.5  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  29.72 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  27.38 
 
 		 598 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  29.54 
 
 		 578 aa  72  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  25.71 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  27.73 
 
 		 584 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  27.62 
 
 		 347 aa  69.3  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  30.67 
 
 		 577 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  28.09 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  26.81 
 
 		 570 aa  66.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  25.51 
 
 		 586 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  26.81 
 
 		 576 aa  65.5  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  27.23 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  25.29 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  23.6 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  23.6 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  28.81 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4865  hypothetical protein  29.03 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  28.69 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  28.75 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  29.13 
 
 		 557 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  27.41 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  25.7 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  26.86 
 
 		 614 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  26.36 
 
 		 576 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  34.32 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  28.09 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  26.88 
 
 		 584 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  28.09 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  28.09 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  25.61 
 
 		 574 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  26.83 
 
 		 560 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  24.6 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>