More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001321 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  100 
 
 		 350 aa  728    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  74.86 
 
 		 350 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  31.44 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  32.83 
 
 		 374 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1199  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0236987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  27.08 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0759  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  27.62 
 
 		 372 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13801  hypothetical protein  37.66 
 
 		 363 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.8447  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 371 aa  95.9  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  29.59 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.08 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  32.91 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  24.69 
 
 		 350 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  24.92 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 		 390 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 401 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.18 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 384 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  28.25 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  31.19 
 
 		 390 aa  90.1  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 		 384 aa  90.1  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  28.06 
 
 		 439 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 		 378 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  26.3 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  32.8 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3442  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0744  glycosyl transferase, group 1  25.33 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  24.61 
 
 		 350 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 362 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  28.03 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.57 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  26.72 
 
 		 369 aa  86.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 		 370 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  31.9 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  28.12 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3442  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  24.32 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  34.94 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5063  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  33.54 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.65 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3569  glycosyl transferase, group 1  24.07 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798632  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  26.59 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  33.9 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  32.57 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  27.6 
 
 		 378 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.04 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.78 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  32.2 
 
 		 389 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  25.49 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>